p <- p + geom_bar(aes(fill = log2(CPM + 1)), stat = "identity") 错误: unexpected symbol 于 "# 再添加geom_bar图层 p"
时间: 2024-09-27 19:09:47 浏览: 40
这个R语言的代码片段看起来像是用于ggplot2包中的绘图操作。`p <- p + geom_bar()`是用来向已有的图形对象`p`追加一个新的bar图。其中参数解释如下:
- `aes(fill = log2(CPM + 1))`: 使用`aes`函数设定图形的填充颜色,这里设置根据`CPM + 1`的对数值进行分组填充。
- `stat = "identity"`: 指定bar图的数据统计方法为“保持原样”,即直接使用输入数据的值,不做进一步的计算。
然而,报错信息提到`unexpected symbol`和`于`,这可能是由于语法错误或者缺失了某些必要的括号、分号或者变量赋值。例如,`log2(CPM + 1)`这部分可能是期望在某个上下文中被计算,如果没有明确的对象引用或者函数调用,就会导致错误。
正确的代码应该是在适当的地方定义了`CPM`变量,并且`p`应该是已经有一个`geom_bar`图层的对象,接着才做后续的操作。修复错误的一个例子可能是:
```r
# 假设cpm_data是一个数据框,其中包含'CPM'列
cpm_data <- ... # 填充实际数据
# 如果CPM列不在data中,需要先计算
if (!"CPM" %in% colnames(cpm_data)) {
cpm_data$CPM <- cpm_data$your_column_name + 1
}
# 初始化图形
p <- ggplot(data = cpm_data, aes(x = your_x_variable, fill = log2(CPM)))
# 添加bar图层
p <- p + geom_bar(stat = "identity")
# 然后继续追加其他图层或者修改图形属性
```
如果你遇到具体的错误提示,提供完整的错误信息会有助于更准确地定位问题。
阅读全文