RNA-seqKEGG富集
时间: 2024-08-26 14:01:38 浏览: 52
RNA-seq数据分析实用方法(2015)
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RNA-seq(全称为RNA测序)是一种高通量的技术,用于研究转录组水平的基因表达变化。它通过分析样本中的RNA分子,尤其是mRNA(信使RNA),来确定哪些基因在特定条件下被转录、剪切以及翻译成蛋白质。KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是一个综合性的数据库和工具集合,主要用于整合生物信息学数据,包括代谢途径、信号传导通路等。
当进行RNA-seq数据的KEGG富集分析时,研究人员会将实验得到的显著差异表达基因(DEGs,Differentially Expressed Genes)与KEGG数据库中的各种通路关联起来,以了解这些基因在生物学过程中的功能关联。通过统计显著性测试(如 enrichment analysis),可以评估一组基因是否更倾向于集中在某个特定的KEGG路径上,超过随机分布。这有助于识别疾病相关的生物学机制、药物靶点等。
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