你能否发现该代码的一些问题并改正？

从提供的代码来看，存在一些小的问题或改进空间。以下是几个可能存在的问题及改进建议：

1. 变量命名不规范：如`_match`函数应改为`def_match`更合适；
2. `distance_matrix`中的`_init_x`, `_init_y`, `_init_m`函数定义应当被移出此函数，作为独立的初始化函数；
3. 输入提示有误导性：“long sequence”、“short sequence”，实际上应该强调输入的是目标序列和查询序列，且长度不一定一长一短；
4. 打印结果中的变量名直接嵌入字符串不够美观，可以改进格式化输出。

修正后的相关部分代码如下所示：

def def_match(s, t, i, j):
    # 原来的 _match 函数
    ...

# 初始化矩阵值
def init_x(i, j):
    ...
def init_y(i, j):
    ...
def init_m(i, j):
    ...

# 计算距离矩阵
def distance_matrix(s, t):
    ...
    X = [[init_x(i, j) for j in range(0, dim_j)] for i in range(0, dim_i)]
    Y = [[init_y(i, j) for j in range(0, dim_j)] for i in range(0, dim_i)]
    M = [[init_m(i, j) for j in range(0, dim_j)] for i in range(0, dim_i)]
    ...
    
seq_target = input("请输入目标序列:")
seq_query = input("请输入查询序列:")
[X, Y, M] = distance_matrix(seq_target, seq_query)
[str_target, str_query] = backtrace(seq_target, seq_query, X, Y, M)

score = M[len(seq_query)][len(seq_target)]
print(f"对齐得分: {score}")
print(f"{str_target}\n{str_query}")

这样不仅提高了代码可读性和维护性，也使得程序运行更加清晰明了。