谱聚类算法python代码
时间: 2023-05-28 13:01:13 浏览: 230
python实现谱聚类代码并进行可视化
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以下是一个简单的python代码实现谱聚类算法:
```python
import numpy as np
from sklearn.cluster import KMeans
def similarity_matrix(X, sigma=1.0):
n = X.shape[0]
S = np.zeros((n, n))
for i in range(n):
for j in range(n):
if i != j:
diff = X[i] - X[j]
S[i][j] = np.exp(-np.dot(diff, diff) / (2.0 * sigma**2))
return S
def laplacian_matrix(S):
n = S.shape[0]
D = np.diag(np.sum(S, axis=1))
L = D - S
return L
def spectral_clustering(X, k, sigma=1.0):
S = similarity_matrix(X, sigma)
L = laplacian_matrix(S)
eig_vals, eig_vecs = np.linalg.eig(L)
idx = eig_vals.argsort()[:k]
eig_vecs = eig_vecs[:, idx]
norm_sq = np.sum(eig_vecs**2, axis=1, keepdims=True)
Y = eig_vecs / np.sqrt(norm_sq)
kmeans = KMeans(n_clusters=k, random_state=0).fit(Y)
return kmeans.labels_
```
该代码包含了以下功能:
- `similarity_matrix(X, sigma=1.0)`:计算样本点之间的相似度矩阵。
- `laplacian_matrix(S)`:计算拉普拉斯矩阵。
- `spectral_clustering(X, k, sigma=1.0)`:实现谱聚类算法,返回聚类标签。
注意,该代码使用了scikit-learn中的KMeans模型进行最终的聚类,因此需要事先安装scikit-learn。此外,该代码实现了简单的谱聚类算法,可能在实际应用中需要进行优化和改进。
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