写一个GAM分析数据的R代码
时间: 2024-10-17 12:04:28 浏览: 73
在R语言中,使用mgcv包来进行Generalized Additive Models (GAMs)分析数据。这里是一个基本的例子,假设我们有一个名为df的数据框,其中包含响应变量y和几个连续及分类特征x1, x2和factor_x3:
```R
# 首先安装并加载必要的包
if (!requireNamespace("mgcv", quietly = TRUE)) {
install.packages("mgcv")
}
library(mgcv)
# 假设数据集已经存在
data(df)
# 定义模型
gam_model <- gam(
y ~ s(x1, k = 5, bs = "cs") + s(x2, m = 3, by = factor_x3) + x3,
family = gaussian(), # 如果y是连续的,通常用gaussian()
data = df
)
# 训练模型
gam_fit <- gam_model
# 模型摘要
summary(gam_fit)
# 可视化部分模型
plot(gam_fit, select = c("x1", "x2"))
# 进行预测
new_data <- data.frame(x1 = ..., x2 = ..., factor_x3 = ..., x3 = ...)
predictions <- predict.gam(gam_fit, newdata = new_data, type = "response")
# 结果评估
residuals <- resid(gam_fit)
qqnorm(residuals)
```
在这个例子中,`k`和`m`分别用于设定`s()`函数(如B-splines或P-splines)中的多项式阶数,`bs = "cs"`表示截断多项式基,`by = factor_x3`则表明x2的光滑曲线会针对每个因子水平进行分离。`family = gaussian()`指定了线性回归模型。
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