以以R中自带的ChicagoNMMAPS数据集为例,在r中用gam函数建立广义相加模型时,如何确定参数项及非参数平滑项
时间: 2024-02-21 17:56:41 浏览: 156
在R中使用gam函数建立广义相加模型时,需要确定以下参数项:
- formula:指定响应变量和预测变量的关系式,形如y ~ s(x1) + s(x2) + x3,其中y为响应变量,x1和x2为需要进行非参数平滑的预测变量,x3为需要进行参数拟合的预测变量。
- data:数据集,包含响应变量和所有预测变量。
- family:响应变量的分布类型,可以是高斯、二项式等。
- method:指定模型拟合的优化算法,默认为GCV,也可以选择REML等。
在确定参数项后,需要决定哪些预测变量需要进行非参数平滑。通常可以通过可视化探索来确定非参数平滑的变量。以ChicagoNMMAPS数据集为例,可以使用ggplot2包中的ggplot函数进行可视化探索。例如,以下代码可以绘制pm25与时间的散点图:
```
library(ggplot2)
ggplot(ChicagoNMMAPS, aes(x=time, y=pm25)) + geom_point()
```
根据图形可以发现,pm25与时间之间的关系不是线性的,可以考虑对时间进行非参数平滑。可以使用以下代码建立广义相加模型:
```
library(mgcv)
model <- gam(pm25 ~ s(time) + temperature + humidity, data=ChicagoNMMAPS, family=gaussian())
summary(model)
```
其中,s(time)表示对时间进行非参数平滑,temperature和humidity为需要进行参数拟合的预测变量。使用summary函数可以查看模型的拟合结果,包括每个变量的系数、平滑项的平滑系数等等。
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