怎么用公式计算多个变量的SINDy模型的BIC,附python代码
时间: 2024-09-22 11:00:46 浏览: 40
pySINDy:SINDy(非线性动力学的稀疏识别)算法
SINDy(Sparse Identification of Nonlinear Dynamics)是一种用于发现非线性动力学系统的模型识别算法。在SINDy中,给定一组观测数据,我们通常会尝试找出最简单的数学函数组合,即包含最少项的多项式或非线性函数,来解释数据背后的动态过程。BIC(Bayesian Information Criterion)是一种模型选择准则,它考虑了模型复杂度与拟合优度之间的平衡。
计算SINDy模型的BIC,首先要对每个潜在的动力学项进行系数估计,然后基于似然函数、模型参数数量以及样本大小来计算。BIC公式一般形式为:
\[ \text{BIC} = -2 \cdot \ln(\mathcal{L}) + k \cdot \ln(n) \]
其中:
- \( \mathcal{L} \) 是似然函数值,表示模型对于数据的拟合程度。
- \( k \) 是模型的复杂度,等于非零模型参数的数量。
- \( n \) 是数据点的数量。
Python中计算BIC的一个基本步骤如下:
```python
import numpy as np
from scipy.optimize import curve_fit
from sklearn.linear_model import LinearRegression
def model_function(x, *params):
# 这里应该替换为你得到的多项式或非线性函数表达式
return params[0] * x**params[1] + params[2] # 示例:一次多项式
# 假设你已经有了数据(x_data, y_data)
x_data = ...
y_data = ...
# 使用curve_fit估计模型参数并计算残差平方和
popt, _ = curve_fit(model_function, x_data, y_data)
bic_value = len(popt) * np.log(len(y_data)) - 2 * np.sum(np.power(y_data - model_function(x_data, *popt), 2))
bic_value
```
记得根据实际的SINDy模型结果调整`model_function`函数,并处理好系数估计后的零填充和剪枝,因为SINDy通常返回稀疏解。
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