当输入数据有四列时,如何计算SINDy模型的bic,附python代码
时间: 2024-09-21 14:05:44 浏览: 59
在SINDy (Sparse Identification of Nonlinear Dynamics) 模型中,BIC (Bayesian Information Criterion) 通常用于模型选择,它考虑了模型的复杂度和拟合优度。当数据集包含四列(即四个特征变量)时,我们首先需要对数据进行线性化处理并估计系数矩阵,然后基于该矩阵的不同阶数多项式来构建模型序列。最后,对于每个模型,我们会计算其对应的残差平方和RSS (Residual Sum of Squares) 和自由度df,以及样本大小n。BIC公式一般如下:
\[ BIC = \log(n) \cdot df + k \cdot \log(n) \]
其中,
- \( n \) 是样本数量,
- \( df \) 是模型的自由度,等于特征的数量减去1(因为模型常数项会固定一个自由度),
- \( k \) 是模型中的系数数量。
Python中计算SINDy的BIC可以使用以下步骤编写,假设已经有一个pandas DataFrame `data`,列名分别为'time', 'x1', 'x2', 'x3'(x4可能被其他列替换),并且`scikit-learn`库已经被安装:
```python
import numpy as np
from sklearn.linear_model import LinearRegression
from scipy.sparse import csc_matrix
from sklearn.metrics import mean_squared_error
# 提取时间步长和特征数据
time = data['time'].values
X = data[['x1', 'x2', 'x3']].values # 假设最后一列不是特征
# 对于每阶多项式,构建并训练模型
max_degree = 5 # 高度最大到五次多项式
bic_values = []
for degree in range(1, max_degree + 1):
# 线性化处理
poly_features = PolynomialFeatures(degree=degree).fit_transform(X)
# 创建稀疏索引矩阵
X_sindy = csc_matrix(poly_features)
# 训练SINDy模型,这里通常使用Lasso回归
lasso = Lasso(alpha=0.1)
model = lasso.fit(X_sindy, time)
# 计算RSS和df
y_pred = model.predict(X_sindy)
rss = mean_squared_error(time, y_pred)
df = X_sindy.shape[1] - 1 # 因为常数项已被考虑
# 计算BIC
bic = np.log(len(time)) * df + degree * np.log(len(time))
bic_values.append(bic)
# 最后,找到BIC最低的模型作为最优模型
best_degree = bic_values.index(min(bic_values))
```
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