pair_coeff
时间: 2024-01-13 18:04:19 浏览: 47
pair_coeff是LAMMPS中用于设置原子对势系数的命令。它用于为不同类型的原子对设置相互作用参数。下面是一个关于pair_coeff的例子:
```shell
pair_coeff 1 1 1.0 1.0
pair_coeff 1 2 1.0 1.2
pair_coeff 2 2 1.2 1.2
```
上述例子中,我们设置了三种原子对之间的相互作用参数。第一行表示类型1的原子与类型1的原子之间的相互作用参数为1.0和1.0。第二行表示类型1的原子与类型2的原子之间的相互作用参数为1.0和1.2。第三行表示类型2的原子与类型2的原子之间的相互作用参数为1.2和1.2。
需要注意的是,具体的参数值需要根据你的模拟系统和所使用的势函数进行设置。
相关问题
pair_coeff * * BNC.tersoff C
在分子动力学模拟中,`pair_coeff` 是一个命令或函数,用于设置原子之间的相互作用势函数系数。在你提供的例子中,`* * BNC.tersoff C` 是一种用于描述碳-氮化硼(BN)体系的 Tersoff 势函数的输入参数。
在这里,`* *` 表示对所有原子类型的相互作用进行设置,`BNC.tersoff` 是一个 Tersoff 势函数文件的名称,而 `C` 则是要设置的原子类型。
Tersoff 势函数是一种常用的描述原子间相互作用的模型,特别适用于描述碳化物、氮化物等材料的化学键。它基于原子之间的键长、键角和配位数等参数,并通过调节势函数的系数来准确描述原子间相互作用。
通过设置 `pair_coeff` 的参数,你可以使用 Tersoff 势函数来模拟碳-氮化硼体系中不同原子之间的相互作用。这将有助于研究该体系的结构、热力学性质和动力学行为。请注意,具体的参数设置可能因具体模拟软件和模型而略有不同,你可能需要参考相应软件的文档或相关文献来获取更详细的信息。
dimension 3 boundary s p p units metal atom_style atomic neighbor 2.0 bin neigh_modify every 1 delay 0 check yes pair_style eam region box block 0 119.295 -10 46 -10 46 units box create_box 2 box lattice fcc 3.6150 region Cu block 0 119.295 0 36.15 0 36.15 units box create_atoms 1 region Cu pair_coeff * * Cu_u3.eam region left block INF 0.1 INF INF INF INF units box group left region left region right block 119.1 INF INF INF INF INF units box group right region right group cu subtract all left right timestep 0.002 thermo 100 thermo_style custom step temp pxx pyy pzz thermo_modify flush yes velocity cu create 300 5645354 loop local dist gaussian rot yes #dump mydump1 all atom 10000 atom1.lammpstrj fix fxnvt cu nvt temp 300.0 300.0 0.2 run 100000 fix 1 right move linear 0.01 0.0 0.0 # Store final cell length for strain calculations variable tmp1 equal "lx" variable tmp2 equal "ly" variable tmp3 equal "lz" variable L0 equal ${tmp1} print "Initial Length, L0: ${L0}" variable strain equal "-(v_L0 - lx)/v_L0" variable p1 equal "v_strain" compute myp all stress/atom NULL compute mypx all reduce sum c_myp[1] variable x2 equal 0.0001*c_mypx[1]/(lz*lx*ly) fix def1 all print 1000 "${p1} ${x2}" file compress1.txt screen no run 500000 提示报错ERROR: Variable x2: Mismatched compute in variable formula (../variable.cpp:1592),应该如何修改?
您好!根据错误提示,出现了“Variable x2: Mismatched compute in variable formula”错误,这意味着在计算中存在错误。在您的输入中,变量 x2 的计算公式中使用了 compute mypx,但是没有定义该 compute。
为了解决这个问题,您需要在使用变量 x2 的计算公式之前,先定义 compute mypx。您可以在输入文件中添加以下代码来定义 compute mypx:
```plaintext
compute mypx all reduce sum c_myp[1]
```
将其添加在 `variable x2 equal 0.0001*c_mypx[1]/(lz*lx*ly)` 之前,并重新运行模拟。这样应该就能够解决错误并计算出正确的结果了。
希望能对您有所帮助!如果您还有其他问题,请随时提问。
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