在network构图,节点特征不一致,有的是18有的是19,这样的话如何传入pyg进行图卷积 代码实现,不填充缺失维度,可以先把特征进行降维操作
时间: 2024-09-26 22:14:38 浏览: 32
时空图卷积网络STGCN用于交通预测的深度学习框架python程序源代码+设计文档
在网络图建模中,如果节点特征维度不一致,例如有些节点有18维特征,有些有19维,可以直接将每个节点的特征视为一个独立向量,而不是统一的固定大小。在PyTorch Geometric (PyG)库中,处理这种情况的一个常见做法是:
1. **创建张量列表**:首先,对于所有节点,分别存储它们的特征作为单独的Tensor。例如:
```python
node_features_list = [torch.tensor(node_data[i].features, dtype=torch.float) for i in range(num_nodes)]
```
这里的`node_data`是一个包含节点信息的数据结构,如DGL的NodeData或者其他类似容器。
2. **动态张量堆叠**:由于PyG的`DataLoader`和`GraphConv`等模块通常需要张量的形状一致性,我们可以使用`stack`函数将这些单个特征张量堆叠到一起,形成一个`batch_size x max_num_node_features`的二维矩阵,其中`max_num_node_features`即为最大特征维度,这里是19。注意这里不会填充0,而是保持稀疏形式。
```python
node_features = torch.stack(node_features_list, dim=0)
```
3. **构建动态图**:接着,你可以创建一个`Data`对象,将堆叠后的特征与边信息、邻接矩阵等结合在一起。因为PyG允许动态图,所以不需要担心形状不匹配的问题。
```python
edge_index, edge_attr = ... # 获取边的信息
data = Data(x=node_features, edge_index=edge_index, edge_attr=edge_attr)
```
4. **图卷积层**:最后,使用`GCNConv`, `SGCNConv`或其他支持动态输入的图卷积层,对数据进行卷积操作。
```python
model = GCNConv(max_num_node_features, hidden_channels) # 使用最大特征维度作为输入通道数
out = model(data.x, data.edge_index)
```
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