% originally, this weight calculation should be: % weight = distances(neighbor_index).^(-2/(m-1)); % but since we didn't take sqrt above and the inverse 2th power % the weights are: % weight = sqrt(distances(neighbor_index)).^(-2/(m-1)); % which is equaliavent to:
时间: 2024-04-09 18:31:12 浏览: 78
这段注释解释了权重计算的原始公式和调整后的公式。
原始的权重计算公式应为 `weight = distances(neighbor_index).^(-2/(m-1))`,其中 `m` 是一个参数。这个公式要求先对距离向量 `distances` 进行平方根操作,然后再取倒数的平方。
然而,在之前的代码中并没有进行平方根操作和取倒数的平方,所以需要对权重计算公式进行调整。
调整后的公式为 `weight = sqrt(distances(neighbor_index)).^(-2/(m-1))`,即先对距离向量 `distances` 进行平方根操作,再取倒数的平方。
这两个公式是等价的,只是由于之前的代码没有进行平方根操作,所以使用调整后的公式来保持一致性。
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neighbor_index = indeces(1:k_values(k)); weight = ones(1,length(neighbor_index)); if fuzzy, % originally, this weight calculation should be: % weight = distances(neighbor_index).^(-2/(m-1)); % but since we didn't take sqrt above and the inverse 2th power % the weights are: % weight = sqrt(distances(neighbor_index)).^(-2/(m-1)); % which is equaliavent to: weight = distances(neighbor_index).^(-1/(m-1)); % set the Inf (infite) weights, if there are any, to 1. if max(isinf(weight)) % warning(['Some of the weights are Inf for sample: ' ... % num2str(i) '. These weights are set to 1.']); weight(isinf(weight))=1; end end
这段代码根据排序后的索引值 `indeces`,选择前 `k_values(k)` 个邻居的索引,并将其赋值给变量 `neighbor_index`。
接下来,代码创建了一个长度为 `length(neighbor_index)` 的全一向量,并将其赋值给变量 `weight`。
如果 `fuzzy` 变量为真(即非零),则进行模糊权重的计算。在这种情况下,权重的计算公式应为 `weight = distances(neighbor_index).^(-2/(m-1))`,其中 `m` 是一个参数。
然而,由于在之前的计算中没有进行平方根操作,以及倒数的平方操作,权重的计算公式需要做相应的调整。具体来说,权重计算公式变为 `weight = distances(neighbor_index).^(-1/(m-1))`。
此外,代码检查权重是否存在无穷大的情况。如果有,则将这些无穷大的权重设置为1。这一步是为了避免权重中出现无穷大导致后续计算出错。
需要注意的是,原始代码中有一段被注释掉的警告信息,提醒一些样本的权重被设置为1。你可以根据需要取消注释并查看警告信息。
以下代码主要功能:class Community(): ''' use set operation to optimize calculation ''' def init(self,G,alpha=1.0): self._G = G self._alpha = alpha self._nodes = set() self._k_in = 0 self._k_out = 0 def add_node(self,node): neighbors = set(self._G.neighbors(node)) node_k_in = len(neighbors & self._nodes) node_k_out = len(neighbors) - node_k_in self._nodes.add(node) self._k_in += 2node_k_in self._k_out = self._k_out+node_k_out-node_k_in def remove_node(self,node): neighbors = set(self._G.neighbors(node)) community_nodes = self._nodes node_k_in = len(neighbors & community_nodes) node_k_out = len(neighbors) - node_k_in self._nodes.remove(node) self._k_in -= 2node_k_in self._k_out = self._k_out - node_k_out+node_k_in
这段代码定义了一个名为Community的类,用于社区检测。该类具有以下功能:
- 初始化函数init(self,G,alpha=1.0),其中G表示待检测的图,alpha表示社区内部边的权重(默认为1.0)。
- 添加节点函数add_node(self,node),其中node表示要添加的节点。该函数会将节点添加到当前社区中,并计算该节点与社区内节点的边权重,更新社区内部边和外部边的权重。
- 移除节点函数remove_node(self,node),其中node表示要移除的节点。该函数会将节点从当前社区中移除,并更新社区内部边和外部边的权重。
这段代码利用集合操作来优化计算,其中self._nodes表示当前社区内的节点集合,neighbors表示当前节点的邻居节点集合,node_k_in表示当前节点与社区内节点的边权重,node_k_out表示当前节点与社区外节点的边权重,self._k_in表示社区内部边的权重,self._k_out表示社区外部边的权重。
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