利用三张表查询在修了C语言程序设计课程和计算机应用基础课程的学生中，C语言程序设计课程的期末成绩比计算机应用基础课程高的所有学生的学号。

这个问题涉及到数据库查询，假设我们有三个关联的表，分别是`Students`、`Courses`和`Grades`，它们的结构可能是这样的：

- `Students` (学生表) 包含字段：StudentID（学号），Name（姓名）
- `Courses` (课程表) 包含字段：CourseID（课程ID），CourseName（课程名称）
- `Grades` (成绩表) 包含字段：StudentID（学号），CourseID（课程ID），Grade（成绩）

查询SQL语句可以如下编写：

SELECT s.StudentID
FROM Students s
JOIN Grades g1 ON s.StudentID = g1.StudentID
JOIN Courses c1 ON g1.CourseID = c1.CourseID AND c1.CourseName = 'C语言程序设计'
JOIN Grades g2 ON s.StudentID = g2.StudentID
JOIN Courses c2 ON g2.CourseID = c2.CourseID AND c2.CourseName = '计算机应用基础'
WHERE g1.Grade > g2.Grade;

这个查询的意思是：从学生表开始，通过学号连接到成绩表，然后分别查找"C语言程序设计"和"计算机应用基础"的课程记录，并比较两门课程的成绩，选择成绩较高的学生学号。