rnaseq数据分析R语言

RNA-Seq是一种高通量测序技术，用于定量和分析转录组中RNA的表达。而R语言是一种广泛应用于数据分析和统计建模的编程语言，因其强大的统计分析能力和丰富的数据可视化功能而被广泛使用。在RNA-Seq数据分析中，R语言可以帮助我们进行数据清洗、差异表达分析、通路分析等操作。以下是RNA-Seq数据分析中R语言常用的一些包及其功能：

1. edgeR: 用于差异表达分析和基因表达量归一化。
2. DESeq2: 用于差异表达分析和基因表达量归一化。
3. limma: 用于差异表达分析和基因表达量归一化。
4. GSEA: 用于基因集富集分析。
5. clusterProfiler: 用于通路富集分析。
6. ggplot2: 用于数据可视化。