r中设置工作环境为/Users/imac/Desktop/summary_process,读取一个csv文件,文件地址为/Users/imac/Desktop/summary_process/output_summary15.csv,paste函数把文件的第4列、第5列、第25列、第17列、第26列、第10列粘贴在一起,在右边加入一个新列,csv原本的内容不删除,粘贴格式为第4列内容::第5列内容::blastx::第25列内容::第17列内容::blastn::第26列内容::第17列内容,再用do包的Replace函数将csv文件中的空格用符号.代替,并输出一个新文件,帮我写一下代码
时间: 2024-03-01 14:50:27 浏览: 55
解决pandas read_csv 读取中文列标题文件报错的问题
好的,以下是R语言的代码实现:
```R
library(data.table)
# 设置工作目录
setwd("/Users/imac/Desktop/summary_process")
# 读取csv文件
data <- fread("output_summary15.csv")
# 选择需要的列
cols <- c(4, 5, 25, 17, 26, 10)
selected_data <- data[, cols]
# 将列粘在一起
text <- apply(selected_data, 1, function(x) {
paste(x[1], x[2], "blastx", x[3], x[4], "blastn", x[5], x[6], sep = "::")
})
# 使用gsub函数将空格替换为.
text <- gsub(" ", ".", text)
# 将文本转化为数据框,并加入新列
new_data <- cbind(data, text)
# 写入新文件
write.csv(new_data, "new_file.csv", row.names = FALSE)
```
其中,`setwd`函数用于设置工作目录,`fread`函数用于读取csv文件,`apply`函数用于将选中的列粘在一起,`gsub`函数用于替换空格,`cbind`函数用于将新列加入原始数据中,`write.csv`函数用于将新数据写入新文件中。请将代码中的文件地址替换为你的csv文件的文件地址,以及将`new_file.csv`替换为你想要生成的新文件的文件名。
阅读全文