R语言转录组中基因表达

R语言是一种常用于生物信息学分析的编程语言，也被广泛应用于转录组学研究中。在转录组中，基因表达是指基因在不同条件下的表达水平。R语言可以用于对基因表达数据进行预处理、差异分析、聚类分析、GO富集分析等多种分析。

在R语言中，常用的基因表达数据处理包括读取数据、数据清洗、标准化、差异分析等。其中，读取数据可以使用read.table()或read.csv()等函数，数据清洗可以使用subset()或filter()等函数，标准化可以使用scale()或normalize()等函数，差异分析可以使用edgeR、DESeq2等包。

此外，R语言还有许多用于可视化基因表达数据的包，如ggplot2、pheatmap等。这些包可以用于绘制热图、箱线图、散点图等多种图形，帮助研究者更好地理解基因表达数据。