用R语言写一个脚本，使用limma做转录组差异表达分析

好的，这是一个使用R语言进行转录组差异表达分析的示例脚本：

# 首先，需要安装并加载limma包
install.packages("limma")
library(limma)

# 然后读入数据
data <- read.csv("transcriptome_data.csv")

# 对数据进行设置，以便输入到limma中
design <- model.matrix(~0 + factor(group))
colnames(design) <- levels(factor(group))
fit <- lmFit(data, design)

# 进行差异表达分析
contrast.matrix <- makeContrasts(groupB-groupA, levels=design)
fit2 <- contrasts.fit(fit, contrast.matrix)

# 获取差异表达基因
diff_expr_genes <- decideTests(fit2)
table(diff_expr_genes)

请注意，此脚本仅作为示例，需要根据实际数据进行修改。