用perl写一个脚本 Th0样本的ratio的平均值和Th17样本的ratio相减的差值添加到最后一列输出到一个文件,再根据此文件再输出差值>=0.1的输出一个文件
时间: 2024-02-26 16:57:51 浏览: 22
好的,我理解你的要求了。下面是一个用 Perl 写的脚本,可以实现你的需求:
```perl
#!/usr/bin/perl
use strict;
use warnings;
# 读取输入文件
open my $fh, '<', 'input.txt' or die "Cannot open input.txt: $!";
my @lines = <$fh>;
close $fh;
# 遍历每一行,计算差值
for my $line (@lines) {
chomp $line;
my ($th0, $th17) = split /\t/, $line;
my $diff = $th0 - $th17;
$line .= "\t$diff\n";
}
# 输出到文件
open $fh, '>', 'output.txt' or die "Cannot open output.txt: $!";
print $fh join("\n", @lines), "\n";
close $fh;
# 过滤差值>=0.1的数据并输出到文件
open $fh, '>', 'filtered.txt' or die "Cannot open filtered.txt: $!";
for my $line (@lines) {
chomp $line;
my ($th0, $th17, $diff) = split /\t/, $line;
if ($diff >= 0.1) {
print $fh "$line\n";
}
}
close $fh;
```
这个脚本假设输入文件的格式是这样的:
```
0.5 0.3
0.2 0.1
...
```
每一行都是两个用制表符分隔的数字,分别表示 Th0 样本和 Th17 样本的 ratio。
脚本的输出包括两个文件:
- `output.txt`:每一行的最后添加了一列,表示 Th0 样本的 ratio 与 Th17 样本的 ratio 相减的差值。
- `filtered.txt`:只包含差值>=0.1的行。
你可以将上面的代码保存为一个名为 `calculate.pl` 的文件,然后在命令行中运行:
```
perl calculate.pl
```
注意要在脚本所在的目录下运行,并且需要保证输入文件 `input.txt` 存在且格式正确。输出文件会生成在同一目录下。
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