package is not available for Bioconductor version '3.16'
时间: 2023-12-23 19:02:53 浏览: 211
这是一个报错信息,并不是一个问题。这个错误信息提示你当前安装的 Bioconductor 版本不支持某个包,可能需要更新 Bioconductor 版本或者使用另外一个版本的该包。你可以尝试升级 Bioconductor 版本,或者使用适合当前版本的该包版本。如果需要更具体的解决方案,请提供更多的上下文信息。
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‘STEM’ is not available for Bioconductor version '3.16'
如果你在使用Bioconductor版本3.16时发现无法安装STEM包,可能是因为STEM包目前还不支持该版本的Bioconductor。你可以尝试更新到最新版本的Bioconductor,或者使用旧版本的Bioconductor来安装STEM包。
如果你想要使用最新版本的Bioconductor,可以在R语言控制台中输入以下命令来更新:
```R
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version = "3.14")
```
这将安装Bioconductor版本3.14,然后你可以使用以下命令来安装STEM包:
```R
BiocManager::install("STEM")
```
如果你选择使用旧版本的Bioconductor,可以在R语言控制台中输入以下命令来安装:
```R
BiocManager::install(version = "3.13")
BiocManager::install("STEM")
```
这将安装Bioconductor版本3.13,然后你可以使用以下命令来安装STEM包。请注意,使用旧版本的Bioconductor可能会限制你在其他方面的功能和兼容性。
BiocManager::install("predictGenes") 'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("repositories", package = "BiocManager")' for details. Replacement repositories: CRAN: https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/cran/ Bioconductor version 3.16 (BiocManager 1.30.20), R 4.2.2 (2022-10-31 ucrt) Installing package(s) 'predictGenes' Warning message: package 'predictGenes' is not available for Bioconductor version '3.16' A version of this package for your version of R might be available elsewhere, see the ideas at https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages
根据错误提示,`predictGenes` 包似乎不适用于你的 R 版本和 Bioconductor 版本。你可以尝试以下解决方案:
1. 检查一下你的 R 和 Bioconductor 版本是否支持 `predictGenes` 包。你可以在 Bioconductor 的官方网站上查看 `predictGenes` 包的版本和兼容性信息。
2. 如果 `predictGenes` 包不适用于你的 R 和 Bioconductor 版本,你可以尝试升级或降级 R 和/或 Bioconductor 版本,以便符合 `predictGenes` 包的要求。
3. 如果你无法升级或降级 R 和/或 Bioconductor 版本,你可以尝试在其他镜像源中查找相应的 `predictGenes` 包版本。你可以使用 `BiocManager::repositories()` 函数查看当前的镜像源,或使用 `BiocManager::install()` 函数安装其他镜像源中的 `predictGenes` 包。
4. 如果你找不到适用于你的 R 和 Bioconductor 版本的 `predictGenes` 包版本,你可以尝试使用其他函数或工具来完成你的任务。你可以在 R 的 CRAN 和 Bioconductor 上查找其他的基因预测函数或工具。
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