BiocManager::install("GlimmerHMM",force = TRUE) 'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("repositories", package = "BiocManager")' for details. Replacement repositories: CRAN: https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/cran/ Bioconductor version 3.16 (BiocManager 1.30.20), R 4.2.2 (2022-10-31 ucrt) Installing package(s) 'GlimmerHMM' Warning message: package 'GlimmerHMM' is not available for Bioconductor version '3.16' A version of this package for your version of R might be available elsewhere, see the ideas at https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages
时间: 2024-04-28 19:23:25 浏览: 15
这个警告信息表明您当前使用的R版本是4.2.2,而您尝试安装的`GlimmerHMM`包不适用于您正在使用的Bioconductor版本3.16。这可能是因为这个包的更新版本需要更高版本的Bioconductor或R。
您可以尝试以下解决方法:
1. 尝试更新您的Bioconductor版本。您可以使用以下命令来更新Bioconductor:
```
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version = "3.15")
```
这将安装Bioconductor 3.15版本,这个版本中包含了适用于R 4.2.2的`GlimmerHMM`包。
2. 如果更新Bioconductor后仍然无法安装`GlimmerHMM`包,您可以尝试安装`GlimmerHMM`包的旧版本。您可以在Bioconductor网站上找到每个包的历史版本。例如,要安装`GlimmerHMM`包的旧版本,您可以使用以下命令:
```
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("GlimmerHMM", version = "1.22.1")
```
这将安装`GlimmerHMM`包的1.22.1版本,这个版本适用于Bioconductor 3.16和R 4.2.2。
希望这可以帮助您解决问题。