BiocManager::install("Rsubread") 'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("repositories", package = "BiocManager")' for details. Replacement repositories: CRAN: https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/cran/ Bioconductor ve解决办法

时间: 2023-07-08 11:53:27 浏览: 758
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posterior:后R包

这段信息是R语言中安装Rsubread包时会出现的提示信息，它提醒你安装Rsubread包时会用到CRAN镜像和Bioconductor镜像，其中Bioconductor镜像是Rsubread包的默认安装源，但是这个命令会临时将Bioconductor镜像替换为CRAN镜像。如果你想使用默认的Bioconductor镜像，可以使用如下命令： ```{r} if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Rsubread", ask = FALSE, site_repository = BiocManager::repositories()) ``` 这个命令中的`site_repository = BiocManager::repositories()`参数会将Bioconductor镜像设置为默认安装源。同时，`ask = FALSE`参数可以让安装过程不需要你确认。
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BiocManager::install("Rsubread") 'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("repositories", package = "BiocManager")' for details. Replacement repositories: CRAN: https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/cran/ Bioconductor ve

ry often updates its packages and dependencies, so it is recommended to use the Bioconductor version of the package if available. You can install the Bioconductor version of Rsubread using the ...

> BiocManager::install("org.Hs.eg.db") 'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("repositories", package = "BiocManager")' for details. Replacement repositories: CRAN: https://cran.rstudio.com/ Bioconductor version 3.16 (BiocManager 1.30.20), R 4.2.2 (2022-10-31) Installing package(s) 'org.Hs.eg.db' Error in readRDS(dest) : error reading from connection怎么回事

这个错误可能是由于网络连接问题或者BiocManager软件包的版本问题导致的。你可以尝试以下解决方法： 1. 确认你的网络连接正常，可以尝试使用其他软件下载或者打开网页检查。 2. 确认你的BiocManager软件包是最新...

> BiocManager::install("org.Hs.eg.db", dependencies = TRUE) 'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("repositories", package = "BiocManager")' for details. Replacement repositories: CRAN: https://cran.rstudio.com/ Bioconductor version 3.16 (BiocManager 1.30.20), R 4.2.2 (2022-10-31) Installing package(s) 'org.Hs.eg.db' also installing the dependencies ‘XML’, ‘annotate’, ‘RUnit’ Error in readRDS(dest) : error reading from connection怎么回事

这个错误提示表明在安装org.Hs.eg.db包以及其依赖包XML、annotate和RUnit...BiocManager::install(c("XML", "annotate", "RUnit", "org.Hs.eg.db"), dependencies = TRUE) 希望以上方法可以解决你的问题。

BiocManager::install("predictGenes") 'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("repositories", package = "BiocManager")' for details. Replacement repositories: CRAN: https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/cran/ Bioconductor version 3.16 (BiocManager 1.30.20), R 4.2.2 (2022-10-31 ucrt) Installing package(s) 'predictGenes' Warning message: package 'predictGenes' is not available for Bioconductor version '3.16' A version of this package for your version of R might be available elsewhere, see the ideas at https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages

你可以使用 BiocManager::repositories() 函数查看当前的镜像源，或使用 BiocManager::install() 函数安装其他镜像源中的 predictGenes 包。 4. 如果你找不到适用于你的 R 和 Bioconductor 版本的 ...

BiocManager::install("GlimmerHMM",force = TRUE) 'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("repositories", package = "BiocManager")' for details. Replacement repositories: CRAN: https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/cran/ Bioconductor version 3.16 (BiocManager 1.30.20), R 4.2.2 (2022-10-31 ucrt) Installing package(s) 'GlimmerHMM' Warning message: package 'GlimmerHMM' is not available for Bioconductor version '3.16' A version of this package for your version of R might be available elsewhere, see the ideas at https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages

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getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("repositories", package = "BiocManager")' for details. Replacement repositories: CRAN: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ Bioconductor version 3.16 (BiocManager 1.30.20), R 4.2.2 (2022-10-31 ucrt) Installing package(s) 'KEGG.db' Setting options('download.file.method.GEOquery'='auto') Setting options('GEOquery.inmemory.gpl'=FALSE) Warning message: package ‘KEGG.db’ is not available for Bioconductor version '3.16' A version of this package for your version of R might be available elsewhere, see the ideas at https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages

getOption("repos")' 替换了Bioconductor标准仓库，请参考'help("repositories", package = "BiocManager")'了解详情。替代仓库：CRAN: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ 。Bioconductor版本3.16 ...

'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("repositories", package = "BiocManager")' for details. Replacement repositories: CRAN: https://mirrors.nju.edu.cn/CRAN/ Bioconductor version 3.16 (BiocManager 1.30.20), R 4.2.2 (2022-10-31 ucrt) Installation paths not writeable, unable to update packages path: C:/Program Files/R/R-4.2.2/library packages: boot, class, codetools, foreign, KernSmooth, lattice, MASS, Matrix, mgcv, nlme, nnet, spatial, survival Warning message: package(s) not installed when version(s) same as or greater than current; use force = TRUE to re-install: 'GenomicFeatures' >

BiocManager::install("GenomicFeatures", force=TRUE) 这将强制重新安装包，覆盖任何现有的版本。 4. 您还可以尝试使用install.packages()函数安装GenomicFeatures包，例如： install.packages(...

setOption() { for (let i = 0; i < this.data.optionData.length; i++) { this.data.optionData[i].options = this.getOption(this.data.optionData[i].title, this.data.optionData[i].data1) console.log(this.data.optionData[i].options) this.chart = this.selectComponent(#echart-pie${i}); console.log(this.chart) this.setData({ optionData: this.data.optionData }) this.chart.initChart() } }, getOption(title, data) { let opation = { title: { text: title, subtext: 'Fake Data', left: 'center' }, tooltip: { trigger: 'item' }, legend: { orient: 'vertical', left: 'left' }, series: [ { name: 'Access From', type: 'pie', radius: '50%', data: data, emphasis: { itemStyle: { shadowBlur: 10, shadowOffsetX: 0, shadowColor: 'rgba(0, 0, 0, 0.5)' } } } ] } return opation },

使用for循遍历this.data.optionData数组中每个元素。 2. 调用this.getOption()方法传入当前元素的title和data1参数，获取图表的项。 3. 打印当前配置项到控制台。 4. 使用thisComponent()方法选择对应...

request.config.getoption

request.config.getoption 是 Pytest 中用来获取命令行参数选项的方法。它可以用来获取在运行 Pytest 时使用命令行设置的选项的值。例如，你可以通过 request.config.getoption("--verbose") 来获取 --verbose...

series: [ { type: "bar", barWidth: "50%", data: [], itemStyle: { emphasis: { shadowColor: '#ff0000', shadowBlur: 20 } },和myChart.off('click'); myChart.on('click', params => { console.log(params); const itemStyle = myChart.getOption().series[0].itemStyle; const color = itemStyle.color(params); console.log('color:', color); itemStyle.emphasis = { shadowColor : color, shadowBlur: 10, // 模糊大小 shadowOffsetX: 0, // 阴影横向偏移量 shadowOffsetY: 0, // 阴影纵向偏移量 }; console.log(itemStyle); console.log('itemStyle.emphasis=>>>>>',itemStyle.emphasis); myChart.setOption({ series: [{ itemStyle: itemStyle }] }); });并不生效

根据您提供的代码，可能存在以下问题： ...您尝试使用 itemStyle.color(params) 获取颜色，但是该方式不是获取当前被点击的数据项的颜色，而是获取整个序列的颜色数组。... 2. 修改 itemStyle.emphasis 属性时，可能...

useEffect(() => { if (name.length > 0 && chartRef.current) { const chart = chartRef.current.getEchartsInstance(); chart.on('finished', () => { const legend = chart.getOption().legend[0]; let currentIndex = 0; const autoScrollInterval = 10000; // 自动滚动的时间间隔（单位：毫秒） const autoScrollLegend = () => { //const pageCount = Math.ceil(legend.data.length / legend.pageData.length); const pageCount =3 currentIndex++; if (currentIndex >= pageCount) { currentIndex = 0; } chart.dispatchAction({ type: 'legendScroll', scrollDataIndex: currentIndex, }); }; const intervalId = setInterval(autoScrollLegend, autoScrollInterval); return () => { clearInterval(intervalId); chart.off('legendscroll', autoScrollLegend); }; }); } }, [name]);

这段代码是使用React的useEffect钩子来监听name的变化，并在chartRef.current存在的情况下执行一些操作。具体来说，它会获取图表实例并在图表完成渲染时执行回调函数。回调函数中，它会获取图表的legend配置项，并...

getOption("repos")$getFrom Error in getOption("repos")$getFrom : $ operator is invalid for atomic vectors

这个错误是在使用getOption("repos")$getFrom时发生的，这意味着你试图在一个原子向量上调用 $ 运算符，而在R语言中，原子向量（如字符向量或数值向量）通常不会支持这种操作。getOption("repos")返回的是一个...

myChart.on('mouseover', (params) => { currName = params.name; let op = myChart.getOption(); if(params.seriesIndex === 0){ let _label = { normal:{ show: true, position: 'center', formatter: [ {a|${params.name}}, {b|${params.percent + "%"}} ].join('\n'), rich: { a: { color:'#fff', fontSize: 18, lineHeight: 30 }, b: { color:'yellow', fontSize: 20, foneWeight:'bold', textShadowBlur: 20, textShadowColor: 'yellow'

然后通过 myChart.getOption() 获取图表的配置项对象，并将其赋值给变量 op。 接下来的代码是根据悬停位置的不同来设置图表的标签显示内容。如果悬停在第一个系列上（通过 params.seriesIndex === 0 判断），...

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在pytest中，config.getoption是一个方法，用于从命令行参数中获取值。它可以在测试用例中使用，以获取通过命令行传入的参数值。在引用中的代码示例中，我们可以看到通过pytestconfig.getoption('--cmdopt')获取--...

self = ChainMap({}, {'im30': 'pax_branch_7.0_3.xx_release', 'im30v2': 'A133_V2_4_T509_pax_branch_release', 'a80': 'pax_branch...3700': 'MTK_android11_pax_branch_user', 'a8300': 'A133_V2_4_pax_branch_release', 'a6650': 'A6650_pax_branch_user'}, {}) key = 'a80s' def __missing__(self, key): > raise KeyError(key) E KeyError: 'a80s' /usr/lib/python3.8/collections/__init__.py:890: KeyError During handling of the above exception, another exception occurred: request = <SubRequest 'upgrade_os_by_fastboot' for <Function test_Antutu_Score_PER1>> get_device_in_config = ('172.16.120.187:6714', '172.16.25.170', 'false', 'A80S', True) get_sn_fastboot_sn = {'1240047508': '241050374620301a044f', '1240193065': '140050344410142b03ce', '1640000442': '1400788643245025084f', '2210000495': 'NRUO65VOT4TWON99', ...} @pytest.fixture(scope='session', autouse=False) def upgrade_os_by_fastboot(request, get_device_in_config, get_sn_fastboot_sn): """ 更新固件 """ _serial, ip, regex, device_name, is_version_test = get_device_in_config # 一些配置参数 # _serial = get_serial logger.info(exec_cmd("adb devices -l")) if util.wait_for_device(_serial, timeout=10 * 60) is False: assert False, "{} device is offline".format(_serial) return # 优先从命令行获取 fastboot_sn = request.config.getoption(CmdOption.DEVICE_FASTBOOT.value) if fastboot_sn is None: fastboot_sn = get_sn_fastboot_sn.get(_serial) if fastboot_sn is None: logger.warning(f"也许你需要在{get_sn_fastboot_sn_map_path()}配置对应的fastboot sn") fastboot_sn = _serial path = os.getcwd() logger.info("upgrade_os_by_fastboot path:%s" % path) logger.info(exec_cmd("rm -rf ./Uniphiz_*")) logger.info(exec_cmd("rm -rf ./PayDroid_*")) logger.info(exec_cmd("rm -rf ./IM30_A80_PayDroid_*")) if is_version_test is False: # CI的日常测试任务 upgrade_result = upgrade_now(_serial, device_name, fastboot_sn, "", "fastboot") else: # CI的版本测试任务 > upgrade_result = upgrade_now_version_test(_serial, device_name, fastboot_sn, "", "fastboot") ../CI_Code_Pull/tests/conftest.py:209: 这是什么错误

这是一个KeyError错误。在你的代码中，__missing__方法被调用时，抛出了一个KeyError异常，因为在字典中找不到键为'a80s'的值。 在这段代码中，你定义了一个名为self的ChainMap对象，并在其中存储了多个字典。...

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