function [trainedModel, rslt, sp] = plsdaKFolds(x, y,... ncomp,preprocess_methods, opts0, folds, x_test, y_test) N = size(y, 1); if isempty(preprocess_methods) preprocess_methods = preprocess('default','autoscale'); end [x_pp, sp] = preprocess('calibrate'
时间: 2024-01-05 13:02:07 浏览: 72
这是一个 Matlab 函数,主要实现了基于 K 折交叉验证的 PLS-DA 模型的建立和评估。函数接受多个输入参数,包括训练集(x 和 y)、组分数(ncomp)、预处理方法(preprocess_methods)、算法选项(opts0)、交叉验证折数(folds)以及测试集(x_test 和 y_test)。函数的输出包括训练好的模型(trainedModel)、模型评估结果(rslt)和预处理参数(sp)。
函数首先获取样本数 N,然后根据预处理方法对训练集进行预处理,得到预处理后的数据 x_pp 和预处理参数 sp。如果预处理方法为空,则使用默认的预处理方法。接着,函数使用 K 折交叉验证将数据集分为训练集和测试集,并对每个训练集进行 PLS-DA 建模和评估。最后,函数对测试集进行预测并评估模型性能。函数的具体实现可以参考其余部分的代码。
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for i = 1:ncomp rslt(i).ncomp = i; cal_p = squeeze(cal_preds(i, :)); cal_p = mode(cal_p,1); cal_t = squeeze(cal_trues(i, :)); cal_t = mode(cal_t,1); [cal_confus, rslt_confusionOrder] = confusionmat(cal_t, cal_p); cal_rslt = statsOfMeasure(cal_confus, 0); rslt(i).cal_confus = cal_confus; rslt(i).cal_rslt = cal_rslt; rslt(i).cal_acc = cal_rslt.microAVG(end-1); rslt(i).cal_sen = cal_rslt.microAVG(end-3); rslt(i).cal_spe = cal_rslt.microAVG(end-2); rslt(i).cal_y_true = cal_t; rslt(i).cal_y_pred = cal_p; val_p = squeeze(val_preds(i, :)); val_t = squeeze(val_trues(i, :)); [val_confus, rslt_confusionOrder] = confusionmat(val_t, val_p); val_rslt = statsOfMeasure(val_confus, 0); rslt(i).val_confus = val_confus; rslt(i).val_rslt = val_rslt; rslt(i).val_acc = val_rslt.microAVG(end-1); rslt(i).val_sen = val_rslt.microAVG(end-3); rslt(i).val_spe = val_rslt.microAVG(end-2); rslt(i).val_y_true = val_t; rslt(i).val_y_pred = val_p; mdl = plsda(x_pp, y, i, opts0); trainedModel{i} = mdl; mdl = plsda(x_test_pp,[],i,mdl, opts0); rslt(i).probability = mdl.classification.probability; y_test_pred = mdl.classification.mostprobable; [test_confus, rslt_confusionOrder] = confusionmat(y_test, y_test_pred); test_rslt = statsOfMeasure(test_confus, 0); rslt(i).test_confus = test_confus; rslt(i).test_rslt = test_rslt; rslt(i).test_acc = test_rslt.microAVG(end-1); rslt(i).test_sen = test_rslt.microAVG(end-3); rslt(i).test_spe = test_rslt.microAVG(end-2); rslt(i).test_y_true = y_test; rslt(i).test_y_pred = y_test_pred; 什么意思
这是一段MATLAB代码,其中包含了一些计算分类模型性能指标的代码,包括计算训练集、验证集和测试集的混淆矩阵、精度、敏感度和特异度等指标,并且包含了使用偏最小二乘判别分析(PLSDA)构建分类模型的代码。具体来说,对于每个组件(i=1:ncomp),代码计算训练集、验证集和测试集的分类性能指标,并将结果存储在一个结构体数组(rslt)中。同时,代码使用PLSDA构建分类模型,并将训练集、测试集的真实标签和预测标签也存储在结构体数组中。
rslt(i).test_acc = test_rslt.microAVG(end-1);什么意思
这行代码的意思是将测试集的精度(accuracy)值赋值给结构体数组 rslt 的第 i 个元素的 test_acc 字段。精度是分类模型的一个重要性能指标,表示模型在测试集上正确分类的样本数占总样本数的比例。而 test_rslt.microAVG 表示计算出的测试集性能指标值,其中 end-1 表示精度值在此数组中的倒数第二个位置。
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