用鸢尾花数据做基于网格CLIQUE算法聚类算法的代码

时间: 2023-07-04 16:18:40 浏览: 53
好的,下面是用鸢尾花数据做基于网格CLIQUE算法聚类算法的 Python 代码: ```python import numpy as np from sklearn import datasets # 鸢尾花数据集 iris = datasets.load_iris() X = iris.data y = iris.target # 网格CLIQUE算法 class GridCLIQUE(): def __init__(self, grid_size=0.5, density_threshold=5): self.grid_size = grid_size self.density_threshold = density_threshold def fit(self, X): n_samples, n_features = X.shape # 网格划分 grid_x = int(np.ceil((np.max(X[:, 0]) - np.min(X[:, 0])) / self.grid_size)) grid_y = int(np.ceil((np.max(X[:, 1]) - np.min(X[:, 1])) / self.grid_size)) grids = np.zeros((grid_x, grid_y), dtype=np.int) for i in range(n_samples): x, y = X[i, :2] x_idx = int(np.floor((x - np.min(X[:, 0])) / self.grid_size)) y_idx = int(np.floor((y - np.min(X[:, 1])) / self.grid_size)) grids[x_idx, y_idx] += 1 # 密度阈值 density = np.zeros((grid_x, grid_y), dtype=np.int) for i in range(grid_x): for j in range(grid_y): x_min = max(0, i - 1) x_max = min(grid_x - 1, i + 1) y_min = max(0, j - 1) y_max = min(grid_y - 1, j + 1) neighbor_grids = grids[x_min:x_max+1, y_min:y_max+1] density[i, j] = np.sum(neighbor_grids) - grids[i, j] threshold = np.percentile(density, 100 - self.density_threshold) # 核心网格单元 core_grids = np.argwhere(density >= threshold) n_core_grids = core_grids.shape[0] core_labels = np.zeros(n_core_grids, dtype=np.int) for i in range(n_core_grids): x, y = core_grids[i] if core_labels[i] == 0: core_labels[i] = i + 1 x_min = max(0, x - 1) x_max = min(grid_x - 1, x + 1) y_min = max(0, y - 1) y_max = min(grid_y - 1, y + 1) neighbor_grids = grids[x_min:x_max+1, y_min:y_max+1] neighbor_density = density[x_min:x_max+1, y_min:y_max+1] for j in range(n_core_grids): if i != j and core_labels[j] == 0: x2, y2 = core_grids[j] if x_min <= x2 <= x_max and y_min <= y2 <= y_max: if neighbor_density[x2-x_min, y2-y_min] >= threshold: core_labels[j] = core_labels[i] # 簇合并 cluster_labels = np.zeros((grid_x, grid_y), dtype=np.int) for i in range(n_core_grids): x, y = core_grids[i] label = core_labels[i] if cluster_labels[x, y] == 0: cluster_labels[x, y] = label x_min = max(0, x - 1) x_max = min(grid_x - 1, x + 1) y_min = max(0, y - 1) y_max = min(grid_y - 1, y + 1) neighbor_labels = cluster_labels[x_min:x_max+1, y_min:y_max+1] for j in range(n_core_grids): if i != j and core_labels[j] == label: x2, y2 = core_grids[j] if x_min <= x2 <= x_max and y_min <= y2 <= y_max: neighbor_labels[core_grids[j, 0]-x_min, core_grids[j, 1]-y_min] = label # 分配剩余网格单元 for i in range(grid_x): for j in range(grid_y): if cluster_labels[i, j] == 0: x_min = max(0, i - 1) x_max = min(grid_x - 1, i + 1) y_min = max(0, j - 1) y_max = min(grid_y - 1, j + 1) neighbor_labels = cluster_labels[x_min:x_max+1, y_min:y_max+1] unique_labels = np.unique(neighbor_labels) if unique_labels.shape[0] == 1: cluster_labels[i, j] = unique_labels[0] else: cluster_labels[i, j] = unique_labels[np.argmax(np.bincount(neighbor_labels.flatten()))] self.labels_ = cluster_labels.reshape(-1) return self # 聚类 grid_clique = GridCLIQUE(grid_size=0.5, density_threshold=5) labels = grid_clique.fit(X[:, :2]).labels_ # 可视化 import matplotlib.pyplot as plt plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=labels) plt.xlabel('Sepal length') plt.ylabel('Sepal width') plt.show() ``` 其中,`GridCLIQUE` 类实现了网格CLIQUE算法,`grid_size` 和 `density_threshold` 分别为网格大小和密度阈值,`fit` 方法用于聚类。 代码中只用了鸢尾花数据的前两个特征(即花萼长度和花萼宽度),并将聚类结果可视化。

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