torch_geometric 输入向量维度
时间: 2023-12-08 10:04:58 浏览: 31
torch_geometric 输入向量的维度取决于任务和数据集的特性。在大多数情况下,输入向量的维度是根据数据集中节点的特征维度来确定的。例如,在节点分类任务中,每个节点可以有一个包含节点特征的向量,其维度由特征的数量确定。类似地,在图分类任务中,每个图可以由一个包含图特征的向量表示,其维度由特征的数量确定。因此,torch_geometric 的输入向量维度取决于数据集中节点或图的特征维度。
相关问题
假设节点特征向量为【N,C】,那么在使用PyTorch Geometric库中的GATConv类时,怎么知道构造的图上有几个节点,每个节点特征向量的维度又是多少
在使用PyTorch Geometric库中的GATConv类时,需要将节点特征向量和邻接矩阵传入模型。在创建数据集时,应该将图的节点数和每个节点特征向量的维度作为参数传入。例如,可以使用`torch_geometric.data.Data`类创建一个数据对象,并将节点特征向量和邻接矩阵存储在该数据对象中:
```python
import torch
from torch_geometric.data import Data
# 构造节点特征向量和邻接矩阵
x = torch.randn(N, C)
edge_index = torch.tensor([...], dtype=torch.long)
# 创建数据对象
data = Data(x=x, edge_index=edge_index)
```
在这个例子中,`N`表示图的节点数,`C`表示每个节点特征向量的维度,`edge_index`表示邻接矩阵。当数据集中有多个数据对象时,每个数据对象的节点数和节点特征向量的维度可能不同。在训练过程中,可以通过`data.num_nodes`和`data.num_features`属性分别获取当前数据对象的节点数和节点特征向量的维度。
GCN使用Pytorch Geometric的方法实现归一化和池化
Pytorch Geometric提供了一些内置的归一化和池化方法,可以方便地用于GCN模型中。下面分别介绍这些方法的用法。
1. 归一化
Pytorch Geometric提供了两种常见的归一化方法:对称归一化和随机游走归一化。
对称归一化:
```python
import torch_geometric.transforms as T
data = T.NormalizeSymm()(data)
```
随机游走归一化:
```python
import torch_geometric.transforms as T
data = T.RandomWalk()(data)
```
其中,`data`是一个包含图数据的对象,比如`torch_geometric.data.Data`。
2. 池化
池化操作可以将一张大图缩小到一张小图,从而减少模型参数和计算量。Pytorch Geometric提供了几种常见的池化方法,比如TopK池化、SAG Pooling和Diff Pooling。
TopK池化:
```python
import torch_geometric.nn.pool as pool
x, edge_index, batch = pool.topk(x, ratio=0.5, batch=batch)
```
其中,`x`是节点特征矩阵,`edge_index`是边的索引矩阵,`batch`是节点所属的图的标识符。`ratio`是池化后每个图保留的节点数占原图节点数的比例。
SAG Pooling:
```python
import torch_geometric.nn.pool as pool
x, edge_index, _, batch, _, _ = pool.sag_pool(x, edge_index, batch)
```
其中,`x`、`edge_index`和`batch`的含义同TopK池化。SAG Pooling使用节点嵌入向量计算每个节点的注意力权重,根据权重进行池化。
Diff Pooling:
```python
import torch_geometric.nn as nn
diffpool = nn.DiffPool(in_channels, hidden_channels, num_classes)
x, edge_index, edge_attr, batch, perm, score = diffpool(x, edge_index)
```
其中,`in_channels`是输入节点特征的维度,`hidden_channels`是池化后节点特征的维度,`num_classes`是分类的类别数。`x`、`edge_index`和`batch`的含义同TopK池化。Diff Pooling使用GraphSAGE卷积层计算每个节点的嵌入向量,根据嵌入向量进行池化。