GCN使用Pytorch Geometric的方法实现归一化和池化
时间: 2024-02-01 08:16:34 浏览: 177
GCN的pytorch实现
Pytorch Geometric提供了一些内置的归一化和池化方法,可以方便地用于GCN模型中。下面分别介绍这些方法的用法。
1. 归一化
Pytorch Geometric提供了两种常见的归一化方法:对称归一化和随机游走归一化。
对称归一化:
```python
import torch_geometric.transforms as T
data = T.NormalizeSymm()(data)
```
随机游走归一化:
```python
import torch_geometric.transforms as T
data = T.RandomWalk()(data)
```
其中,`data`是一个包含图数据的对象,比如`torch_geometric.data.Data`。
2. 池化
池化操作可以将一张大图缩小到一张小图,从而减少模型参数和计算量。Pytorch Geometric提供了几种常见的池化方法,比如TopK池化、SAG Pooling和Diff Pooling。
TopK池化:
```python
import torch_geometric.nn.pool as pool
x, edge_index, batch = pool.topk(x, ratio=0.5, batch=batch)
```
其中,`x`是节点特征矩阵,`edge_index`是边的索引矩阵,`batch`是节点所属的图的标识符。`ratio`是池化后每个图保留的节点数占原图节点数的比例。
SAG Pooling:
```python
import torch_geometric.nn.pool as pool
x, edge_index, _, batch, _, _ = pool.sag_pool(x, edge_index, batch)
```
其中,`x`、`edge_index`和`batch`的含义同TopK池化。SAG Pooling使用节点嵌入向量计算每个节点的注意力权重,根据权重进行池化。
Diff Pooling:
```python
import torch_geometric.nn as nn
diffpool = nn.DiffPool(in_channels, hidden_channels, num_classes)
x, edge_index, edge_attr, batch, perm, score = diffpool(x, edge_index)
```
其中,`in_channels`是输入节点特征的维度,`hidden_channels`是池化后节点特征的维度,`num_classes`是分类的类别数。`x`、`edge_index`和`batch`的含义同TopK池化。Diff Pooling使用GraphSAGE卷积层计算每个节点的嵌入向量,根据嵌入向量进行池化。
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