读取PET的nii图像,并将其大于0的像素赋值为1
时间: 2024-05-10 21:20:22 浏览: 121
以下是Python代码示例:
```python
import nibabel as nib
import numpy as np
# 读取nii文件
img = nib.load('path/to/PET.nii')
# 获取图像数据
data = img.get_fdata()
# 将大于0的像素赋值为1
data[data > 0] = 1
# 创建新的nii图像
new_img = nib.Nifti1Image(data, img.affine)
# 保存新的nii图像
nib.save(new_img, 'path/to/PET_binary.nii')
```
首先,使用nibabel库中的load函数读取nii文件,并获取图像数据。然后,使用NumPy数组索引将大于0的像素赋值为1。接下来,使用Nifti1Image函数创建一个新的nii图像,并指定原始图像的仿射矩阵。最后,使用nibabel库中的save函数将新的nii图像保存到文件中。
相关问题
读取PET的nii图像,并算其大于0的体素的均值
A:以下是Python代码来实现
```python
import nibabel as nib
import numpy as np
# 读取nii图像文件
img = nib.load('path/to/PET.nii')
# 获取图像数据
data = img.get_fdata()
# 计算大于0的体素数
positive_voxels = np.sum(data > 0)
# 计算大于0的体素的均值
mean_positive_voxels = np.sum(data[data > 0]) / positive_voxels
```
注意,`path/to/PET.nii`应该替换为实际的文件路径
读取PET的nii图像,并算其大于0的体素的标准差
A:我不太了解PET和nii图像的相关知识,但理论上可以使用Python中的nibabel库来读取nii图像,再使用numpy库来进行体素值的计算和标准差的求解。以下是一个可能的代码示例:
```
import nibabel as nib
import numpy as np
# 读取nii图像
img = nib.load('path/to/pet.nii.gz')
data = img.get_data()
# 计算大于0的体素的标准差
voxels = data[data > 0]
std = np.std(voxels)
print("标准差:", std)
```
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