写一个python脚本，使用os、sys，输入一个目录，提取其中的Ctrl、rep1、rep2的bam文件作为变量

好的，以下是一个使用os、sys模块提取指定文件的Python脚本示例：

import os
import sys

# 获取命令行参数，即输入的目录路径
dir_path = sys.argv[1]

# 定义需要提取的文件名列表
file_names = ['Ctrl.bam', 'rep1.bam', 'rep2.bam']

# 遍历目录下的所有文件
for root, dirs, files in os.walk(dir_path):
    for file in files:
        # 判断文件名是否在需要提取的列表中
        if file in file_names:
            # 如果是，则输出文件路径
            file_path = os.path.join(root, file)
            print(file_path)

使用示例：

假设以上脚本保存为extract_bam.py，目录结构如下：

.
└── mydir
    ├── Ctrl.bam
    ├── otherfile.txt
    ├── rep1.bam
    └── subfolder
        ├── Ctrl.bam
        ├── rep2.bam
        └── somefile.txt

则在命令行中执行以下命令即可提取指定文件：

python extract_bam.py mydir

输出：

mydir/Ctrl.bam
mydir/rep1.bam
mydir/subfolder/Ctrl.bam
mydir/subfolder/rep2.bam