链路预测代码python
时间: 2023-10-30 12:02:58 浏览: 36
链路预测是指根据已知网络结构和节点属性,预测网络中两个节点之间是否存在连接。链路预测通常用于社交网络分析、蛋白质相互作用网络分析等领域。以下是一个简单的链路预测代码示例,使用Python和networkx库实现:
```python
import networkx as nx
import numpy as np
from sklearn.metrics import roc_auc_score
# 构建网络
G = nx.karate_club_graph()
# 构建特征矩阵
features = np.random.rand(len(G.nodes()), 10)
# 划分训练集和测试集
edges = list(G.edges())
np.random.shuffle(edges)
train_edges = edges[:int(0.8*len(edges))]
test_edges = edges[int(0.8*len(edges)):]
# 构建训练集和测试集的标签
train_labels = [1 if G.has_edge(*edge) else 0 for edge in train_edges]
test_labels = [1 if G.has_edge(*edge) else 0 for edge in test_edges]
# 计算节点相似度
similarity_matrix = np.dot(features, features.T)
# 计算AUC
train_predictions = [similarity_matrix[edge[0], edge[1]] for edge in train_edges]
test_predictions = [similarity_matrix[edge[0], edge[1]] for edge in test_edges]
train_auc = roc_auc_score(train_labels, train_predictions)
test_auc = roc_auc_score(test_labels, test_predictions)
print("Train AUC:", train_auc)
print("Test AUC:", test_auc)
```
以上代码中,我们使用了networkx库构建了一个karate_club_graph网络,随机生成了一个节点特征矩阵,并将其用于计算节点之间的相似度矩阵。然后,我们将网络的边随机划分为训练集和测试集,并根据训练集和测试集的边是否存在来构建标签。最后,我们使用节点相似度矩阵预测训练集和测试集中边的存在,并计算AUC值评估预测效果。