链路预测代码python

时间: 2023-10-30 12:02:58 浏览: 36
链路预测是指根据已知网络结构和节点属性,预测网络中两个节点之间是否存在连接。链路预测通常用于社交网络分析、蛋白质相互作用网络分析等领域。以下是一个简单的链路预测代码示例,使用Python和networkx库实现: ```python import networkx as nx import numpy as np from sklearn.metrics import roc_auc_score # 构建网络 G = nx.karate_club_graph() # 构建特征矩阵 features = np.random.rand(len(G.nodes()), 10) # 划分训练集和测试集 edges = list(G.edges()) np.random.shuffle(edges) train_edges = edges[:int(0.8*len(edges))] test_edges = edges[int(0.8*len(edges)):] # 构建训练集和测试集的标签 train_labels = [1 if G.has_edge(*edge) else 0 for edge in train_edges] test_labels = [1 if G.has_edge(*edge) else 0 for edge in test_edges] # 计算节点相似度 similarity_matrix = np.dot(features, features.T) # 计算AUC train_predictions = [similarity_matrix[edge[0], edge[1]] for edge in train_edges] test_predictions = [similarity_matrix[edge[0], edge[1]] for edge in test_edges] train_auc = roc_auc_score(train_labels, train_predictions) test_auc = roc_auc_score(test_labels, test_predictions) print("Train AUC:", train_auc) print("Test AUC:", test_auc) ``` 以上代码中,我们使用了networkx库构建了一个karate_club_graph网络,随机生成了一个节点特征矩阵,并将其用于计算节点之间的相似度矩阵。然后,我们将网络的边随机划分为训练集和测试集,并根据训练集和测试集的边是否存在来构建标签。最后,我们使用节点相似度矩阵预测训练集和测试集中边的存在,并计算AUC值评估预测效果。

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