使用SMILES表示,将它们编码为一个包含至少两个组的整数列表。下面是一个简单的例子: ```python # 创建一个包含两个列表的SMILES表格 smiles =SMILES(1, 2, 3) # 创建一个包含两个列表的SMILES表格 fruits =SMILES(1, 2, 3) # 创建一个包含两个列表的SMILES表格 fruits_list =smiles.sort_by(fruits[0], fruits[1]) # 将结果保存到文件中 smiles.sort_by(fruits_list[0], sort_by=sort_by) # 打印排序后的排序后的列表 print(fruits_list) ``` 在这个示例中,我们首先定义了一个包含两个列表`fruits`和`sort_by`的Python函数。然后,我们使用`sorted()`函数对排序后的列表进行排序。最后,我们将排序后的列表打印出来。 这是一个简单的示例代码,用于创建一个包含两个列表并分别按照从小到大、排序后进行排序的Python函数。如果你需要更多的帮助,请告诉我。 希望这可以帮助你!
时间: 2024-04-10 21:27:55 浏览: 20
在您的代码中,有一些小错误。下面是修正后的代码:
```python
# 创建一个包含两个列表的SMILES表格
smiles = [1, 2, 3]
fruits = [1, 2, 3]
# 将两个列表合并,并按第一个列表的元素进行排序
fruits_list = sorted(zip(smiles, fruits), key=lambda x: x[0])
# 打印排序后的列表
print(fruits_list)
```
在上述代码中,我们首先定义了两个包含整数的列表,即`smiles`和`fruits`。
然后,使用`zip()`函数将两个列表合并成一个元组的列表。
接下来,使用`sorted()`函数对合并后的列表进行排序,通过指定`key`参数为`lambda x: x[0]`来按照元组中的第一个元素进行排序。
最后,使用`print()`函数打印排序后的列表。
请注意,你在代码中提到了一个函数`sort_by()`,但你没有提供该函数的定义。如果需要进一步帮助,请提供更多详细信息。
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当然,我可以帮你写一个这样的代码。你可以使用PubChemPy库来进行这个任务。首先,你需要在PubChem中搜索每个化合物,然后从搜索结果中提取CID和Isomeric SMILES。以下是代码示例:
```
import pubchempy as pcp
import pandas as pd
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compounds_list = ['水', '氢氧化钠', '氯化钠']
results = []
for compound in compounds_list:
try:
# 在PubChem中搜索化合物
search_results = pcp.get_compounds(compound, 'name')
# 从搜索结果中提取CID和Isomeric SMILES
cid = search_results[0].cid
isomeric_smiles = search_results[0].isomeric_smiles
# 将结果追加到结果列表中
results.append({'Compound': compound, 'CID': cid, 'Isomeric SMILES': isomeric_smiles})
except:
# 如果搜索失败,则将结果追加到结果列表中,但CID和Isomeric SMILES都为空值
results.append({'Compound': compound, 'CID': None, 'Isomeric SMILES': None})
# 将结果转换为DataFrame
results_df = pd.DataFrame(results)
# 将结果保存到CSV文件中
results_df.to_csv('compounds_info.csv', index=False)
```
这个代码将在PubChem中搜索你提供的每个化合物,并从每个搜索结果中提取CID和Isomeric SMILES。然后,它将结果存储到一个CSV文件中,其中包含化合物名称、CID和Isomeric SMILES。注意,有些化合物可能无法在PubChem中找到,如果这样的话,代码将不会崩溃,而是在结果列表中将CID和Isomeric SMILES设置为null。
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可以使用SMILES(Simplified Molecular Input Line Entry System)作为有机物的编码方式,并将其转换为嵌套列表。SMILES是一种字符串表示法,用于表示化学分子的结构。
下面是将SMILES转换为嵌套列表的Python代码示例:
```python
import re
def parse_smiles(smiles):
stack = [[]]
for char in smiles:
if char == '(':
stack.append([])
elif char == ')':
sub = stack.pop()
stack[-1].append(sub)
elif char == '[':
match = re.search(r'\[(.*?)\]', smiles)
bracket_content = match.group(1)
stack[-1].append(bracket_content.split('.'))
smiles = smiles[match.end():]
elif char == '.':
pass
else:
stack[-1].append(char)
return stack[0]
```
上述代码中,我们使用栈数据结构来解析SMILES字符串。当遇到左括号时,我们将一个空列表入栈,表示这是一个嵌套列表的开始。当遇到右括号时,我们将栈顶的列表弹出,并将其作为子列表添加到上一个列表中。当遇到方括号时,我们提取方括号内的内容,并将其转换为列表添加到当前列表中。最后,我们返回栈底的列表,即整个嵌套列表的根节点。
例如,对于丙酮(acetone),其SMILES表示为"CC(=O)C",对应的嵌套列表为:
```python
['C', 'C', ['=', 'O'], 'C']
```
注意,由于SMILES字符串中可能包含数字和其他特殊字符,因此在实际使用中需要进行一些额外的处理。此外,由于SMILES并不是一种唯一的表示法,因此可能存在多种嵌套列表表示相同的化学结构。
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