曼哈顿距离矩阵,python

时间: 2023-07-17 11:12:23 浏览: 136
以下是使用Python编写的计算曼哈顿距离矩阵的代码: ```python def manhattan_distance_matrix(points): n = len(points) distance_matrix = [[0 for _ in range(n)] for _ in range(n)] for i in range(n): for j in range(n): distance_matrix[i][j] = abs(points[i][0] - points[j][0]) + abs(points[i][1] - points[j][1]) return distance_matrix # 示例输入 points = [(1, 2), (3, 4), (5, 6)] distance_matrix = manhattan_distance_matrix(points) # 输出距离矩阵 for row in distance_matrix: print(row) ``` 在这段代码中,`points` 是一个包含点坐标的列表,其中每个点表示为一个二元组 `(x, y)`。`manhattan_distance_matrix` 函数接受这个点列表作为输入,并使用两层循环计算每对点之间的曼哈顿距离,并将结果存储在 `distance_matrix` 中。最后,通过遍历输出 `distance_matrix` 可以查看计算得到的曼哈顿距离矩阵。
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python凝聚层次聚类算法实现(非聚类库函数调用),要求算法输入:随机生成聚类的>=20个对象;算法输出:分类结果,聚类过程中得到的最短距离值以及距离矩阵。考虑单链法single-linkage、全链法complete-linkage和组平均法average-linkage这三种不同距离的计算方法进行聚类。

好的,这是一个比较复杂的问题,需要分步骤来回答。首先,我们需要了解一下凝聚层次聚类算法的基本原理。 凝聚层次聚类算法是一种自下而上的聚类方法,它的基本思想是从每个数据点开始,逐步将相似的数据点合并成一个簇,直到所有数据点都被合并成为一个簇或者达到指定的簇的个数。其中,相似度的计算方法可以采用不同的距离度量方式,如欧几里得距离、曼哈顿距离、余弦相似度等。在本次问题中,我们需要实现三种不同距离度量方式的凝聚层次聚类算法,分别是单链法、全链法和组平均法。 下面,我将分步骤介绍如何实现这个算法。首先是数据的生成。我们可以使用numpy库来生成随机数据,代码如下: ```python import numpy as np np.random.seed(0) X = np.random.rand(20, 5) # 生成20个5维随机向量 ``` 接下来,我们需要计算两两数据点之间的距离,并构建距离矩阵。这里我们可以使用scipy库中的distance函数来计算距离。代码如下: ```python from scipy.spatial.distance import pdist, squareform distances = pdist(X, metric='euclidean') # 计算欧几里得距离 distance_matrix = squareform(distances) # 将距离向量转换为距离矩阵 ``` 接下来是凝聚层次聚类的核心代码。我们可以使用一个列表来存储每个数据点的簇标记,初始时每个数据点都是一个簇,簇标记为数据点的下标。然后,我们可以使用一个字典来存储每个簇的距离,初始时每个簇的距离为无穷大。在聚类过程中,我们需要不断地找到距离最小的两个簇进行合并,直到达到指定的簇的个数。每次合并簇时,我们需要更新每个簇的距离,并将被合并的簇的标记更新为合并后的簇的标记。最后,我们可以返回聚类结果、最短距离值以及距离矩阵。代码如下: ```python def agglomerative_clustering(X, n_clusters, linkage='single'): n_samples = X.shape[0] labels = np.arange(n_samples) # 初始时每个数据点都是一个簇,簇标记为数据点的下标 distances = {i: {j: distance_matrix[i, j] for j in range(i + 1, n_samples)} for i in range(n_samples)} # 初始时每个簇的距离为无穷大 cluster_distances = {i: float('inf') for i in range(n_samples)} def update_distances(i, j, k): # 更新簇k与其他簇的距离 for l in range(n_samples): if l not in (i, j, k): if linkage == 'single': d = min(distances[i][l], distances[j][l]) elif linkage == 'complete': d = max(distances[i][l], distances[j][l]) elif linkage == 'average': d = (distances[i][l] + distances[j][l]) / 2 distances[k][l] = d # 删除簇i和簇j del distances[i], distances[j] # 更新簇距离 for l in distances: if l != k: if linkage == 'single': cluster_distances[l] = min(cluster_distances[l], distances[k][l]) elif linkage == 'complete': cluster_distances[l] = max(cluster_distances[l], distances[k][l]) elif linkage == 'average': cluster_distances[l] = (cluster_distances[l] + distances[k][l]) / 2 for n_clusters in range(n_samples, n_clusters, -1): # 找到距离最小的两个簇进行合并 i, j = min(((i, j) for i in distances for j in distances[i]), key=lambda x: distances[x[0]][x[1]]) k = n_samples - n_clusters # 更新簇标记 labels[labels == i] = k labels[labels == j] = k # 更新距离矩阵 distances[k] = {l: distances[i][l] for l in distances[i]} distances[k].update({l: distances[j][l] for l in distances[j]}) update_distances(i, j, k) return labels, cluster_distances, distance_matrix ``` 最后,我们可以使用上面的代码来分别实现单链法、全链法和组平均法的聚类。代码如下: ```python labels_single, distances_single, distance_matrix_single = agglomerative_clustering(X, 5, linkage='single') labels_complete, distances_complete, distance_matrix_complete = agglomerative_clustering(X, 5, linkage='complete') labels_average, distances_average, distance_matrix_average = agglomerative_clustering(X, 5, linkage='average') ``` 其中,n_clusters参数指定最终要聚成的簇的个数。这里我们聚成了5个簇。最后,我们可以输出聚类结果、最短距离值以及距离矩阵。代码如下: ```python print('Single linkage:') print('Labels:', labels_single) print('Distances:', distances_single) print('Distance matrix:\n', distance_matrix_single) print('Complete linkage:') print('Labels:', labels_complete) print('Distances:', distances_complete) print('Distance matrix:\n', distance_matrix_complete) print('Average linkage:') print('Labels:', labels_average) print('Distances:', distances_average) print('Distance matrix:\n', distance_matrix_average) ``` 注意,这里的距离矩阵是一个对称矩阵,因此只需要输出其中的一半就可以了。 希望我的回答能够帮助你解决问题。如果还有任何疑问,欢迎继续追问!
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