已有xlsx表,第一列为名称,第二列为分类(共有232种),剩余的2048类是特征值,如何基于这个表绘制232分类的二维tsne图,给出python代码
时间: 2024-11-23 14:40:30 浏览: 5
为了基于给定的Excel表格(包含名称列、分类列和2048维特征值列)绘制TSNE(t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding)二维图,你可以使用Python的`pandas`库处理Excel数据,`sklearn`库用于计算TSNE,并结合`matplotlib`展示结果。以下是简单的步骤和代码示例:
首先,安装必要的库,如果你还没有安装,可以使用pip安装:
```bash
pip install pandas numpy matplotlib sklearn
```
然后,按照以下步骤操作:
1. 导入所需的库:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn.manifold import TSNE
import matplotlib.pyplot as plt
```
2. 加载Excel数据并预处理:
```python
# 读取Excel文件
data = pd.read_excel('your_file.xlsx')
# 确保数据已清理,将分类列转换为数值型(假设类别为字符串)
data['分类'] = data['分类'].astype('category').cat.codes
# 提取名称和分类列
X = data[['名称', '分类']].reset_index(drop=True)
X_features = data.drop(['名称', '分类'], axis=1) # 特征值部分
```
3. 对特征值进行归一化(如果需要):
```python
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
scaler = StandardScaler()
X_features_scaled = scaler.fit_transform(X_features)
```
4. 计算TSNE:
```python
n_components = 2 # 输出维度为2D
tsne = TSNE(n_components=n_components, perplexity=30, learning_rate='auto')
X_tsne = tsne.fit_transform(X_features_scaled)
```
5. 绘制二维TSNE图:
```python
plt.figure(figsize=(10, 7))
for i, category in enumerate(data['分类'].unique()):
df_category = X[X['分类'] == category]
plt.scatter(df_category.iloc[:, 0], df_category.iloc[:, 1], label=f'分类 {category}', alpha=0.8)
plt.title("TSNE降维后的232分类分布")
plt.legend(title="分类", scatterpoints=1, loc='best')
plt.show()
```
记得替换 `'your_file.xlsx'` 为你实际的Excel文件路径。
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