def Decode(DNA, value_min, value_max, accuracy): length = len(DNA) bicode = [DNA[0]] for i in range(1, length): bicode.append(DNA[i] ^ bicode[-1]) num = 0 for i in range(length - 1, -1, -1): num += bicode[i] * 2 ** (length - i - 1) value = value_min + num * accuracy while value > value_max: value -= (value_max - value_min) return value
时间: 2024-04-03 08:31:20 浏览: 153
这段代码实现了基因解码的功能,将一个 DNA 序列转化为一个数值,具体实现方法为:
1. 首先将 DNA 序列中的第一个碱基作为二进制码的第一个位。
2. 对于 DNA 序列中的每个碱基,将其与前一个碱基的二进制码进行异或操作,得到当前位置的二进制码。
3. 将得到的二进制码转化为对应的数字,得到一个整数。
4. 将整数转化为对应的实际数值,通过 `value_min` 和 `accuracy` 来计算。
5. 如果计算得到的实际数值超出了指定的范围(`value_min` 到 `value_max` 之间),则通过减去数值范围的长度来进行修正。
例如,对于输入的 DNA 序列 `[1, 0, 1, 0, 1, 1]`,`value_min=0`,`value_max=100`,`accuracy=0.1`,函数将返回 `5.9`,表示基因编码为 `101011` 对应的实际数值为 5.9。
相关问题
帮我改写这段代码,def Decode(DNA, value_min, value_max, accuracy): length = len(DNA) bicode = [DNA[0]] for i in range(1, length): bicode.append(DNA[i] ^ bicode[-1]) num = 0 for i in range(length - 1, -1, -1): num += bicode[i] * 2 ** (length - i - 1) value = value_min + num * accuracy while value > value_max: value -= (value_max - value_min) return value
这段代码的功能是将一段二进制编码(DNA)转换成一个浮点数,这个浮点数的范围在value_min和value_max之间,精度为accuracy。以下是改写后的代码:
```python
def decode(DNA, value_min, value_max, accuracy):
length = len(DNA)
bicode = [DNA[0]]
for i in range(1, length):
bicode.append(DNA[i] ^ bicode[-1])
num = sum([bicode[i] * 2 ** (length - i - 1) for i in range(length - 1, -1, -1)])
value = value_min + num * accuracy
value = value % (value_max - value_min) + value_min if value > value_max else value
return value
```
主要的改动有:
1. 函数名改为小写,并使用下划线分隔单词,符合常规的Python命名规范。
2. 使用了列表推导式来计算num。
3. 在计算value时,使用了取模运算来保证value在范围内,避免了使用while循环。
帮我改写这段代码def get_fitness(DNA, value_min, value_max, accuracy): x = Decode(DNA, value_min, value_max, accuracy) y = x**2 * np.exp(-x/2) * ((math.sin(5 * (x**2))) ** 2) return y # 初始化种群 def init(generation_num, DNA_length): generation = [[random.choice([0, 1]) for i in range(DNA_length)] for j in range(generation_num)] return generation # 选择操作 def select(generation, value_min, value_max, accuracy): fitness_list = [get_fitness(DNA, value_min, value_max, accuracy) for DNA in generation] p_list = [f / sum(fitness_list) for f in fitness_list] idx = list(range(len(generation))) idx_selected = np.random.choice(idx, size=len(generation), replace=True, p=p_list) # 根据概率选择,有放回抽样 return [generation[i] for i in idx_selected]
这段代码的功能是实现了一个遗传算法的基本操作,包括初始化种群、计算个体适应度、根据适应度选择个体等。以下是改写后的代码:
```python
def get_fitness(DNA, value_min, value_max, accuracy):
x = decode(DNA, value_min, value_max, accuracy)
y = x**2 * np.exp(-x/2) * ((math.sin(5 * (x**2))) ** 2)
return y
# 初始化种群
def init_population(generation_num, DNA_length):
return [[random.choice([0, 1]) for i in range(DNA_length)] for j in range(generation_num)]
# 选择操作
def select(generation, value_min, value_max, accuracy):
fitness_list = [get_fitness(DNA, value_min, value_max, accuracy) for DNA in generation]
p_list = [f / sum(fitness_list) for f in fitness_list]
idx_selected = np.random.choice(range(len(generation)), size=len(generation), replace=True, p=p_list)
return [generation[i] for i in idx_selected]
```
主要的改动有:
1. 函数名改为小写,并使用下划线分隔单词,符合常规的Python命名规范。
2. 将初始化种群的函数名从init改为init_population,以避免与Python内置函数init重名。
3. 在选择操作中,简化了代码,去掉了不必要的变量。
阅读全文