在一维点集上执行层次聚类方法假定簇表示其质心每次迭代中将最近的两个簇合并给个Python代码以及解释
时间: 2024-12-21 22:29:49 浏览: 5
在一维点集中执行层次聚类(Hierarchical Clustering)通常涉及计算每个数据点之间的距离,并逐步构建一个树形结构,其中每个节点代表一个簇,由其包含的数据点组成。这里简单描述一种基于单链接(Single Linkage)方法的伪代码示例:
```python
import numpy as np
def single_linkage(points):
# 初始化
distances = np.zeros((len(points), len(points)))
dendrogram = np.zeros(len(points))
for i in range(len(points)):
distances[i][i] = 0
dendrogram[i] = points[i]
while len(dendrogram) > 1:
# 找到当前最小的距离
min_distance_index = np.argmin(distances)
cluster1_idx = min_distance_index // len(points)
cluster2_idx = min_distance_index % len(points)
# 更新新的簇质心
new_cluster_center = (dendrogram[cluster1_idx] + dendrogram[cluster2_idx]) / 2
dendrogram = np.delete(dendrogram, [cluster1_idx, cluster2_idx], axis=0)
dendrogram = np.append(dendrogram, new_cluster_center)
# 更新所有其他簇之间的距离
for j in range(len(dendrogram)):
if j != cluster1_idx and j != cluster2_idx:
distances[j][new_cluster_idx] = np.min([distances[j][cluster1_idx], distances[j][cluster2_idx]])
distances[new_cluster_idx][j] = distances[j][new_cluster_idx]
return dendrogram, distances
# 使用示例
points = np.array([1, 5, 3, 8, 4, 7])
result = single_linkage(points)
clusters, distance_matrix = result
```
在这个例子中:
1. `single_linkage` 函数接受一个一维数组 `points` 作为输入。
2. 初始时,每个点都是单独的一个簇,距离矩阵初始化为零,每行对应一个点,对角线元素是该点自身的距离(设为0)。
3. 循环直到只剩下一个簇,每次迭代找到两个最近的簇并合并,然后更新距离矩阵以反映新簇与其他簇的距离。
4. 最终返回的结果是一个簇树 `dendrogram` 和原始的距离矩阵 `distance_matrix`。
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