在一维点集(1,4,9,16,25,36,49,64,81)上执行层次聚类方法,假定簇表示其质心,每次迭代中将最近的两个簇合并。用python3
时间: 2024-12-21 16:29:16 浏览: 15
在一维点集中执行层次聚类(Hierarchical Clustering),你可以使用Python中的scipy库,特别是其中的`cluster.hierarchy`模块。这里是一个简单的步骤说明:
首先,你需要导入所需的库并准备数据:
```python
import numpy as np
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage
# 提供的一维点集
points = [1, 4, 9, 16, 25, 36, 49, 64, 81]
```
然后,创建一个数组来存储距离矩阵,这将是层次聚类的基础:
```python
distance_matrix = np.array(points).reshape(-1, 1) - np.array(points)
```
接下来,计算连接矩阵,也就是相似度矩阵:
```python
Z = linkage(distance_matrix, 'ward') # 使用 Ward 聚类准则,也可以尝试其他方法如单链法(single)、完全链法(complete)等
```
`linkage()`函数返回的是树形结构(通常称为Dendrogram),可以可视化这个结构:
```python
plt.figure(figsize=(10, 5))
dendrogram(Z, labels=range(1, len(points)+1), leaf_font_size=12)
plt.title('Hierarchical Clustering Dendrogram')
plt.xlabel('Points')
plt.ylabel('Distance')
plt.show()
```
最后,根据需要确定何时停止合并(例如当达到特定的距离阈值或节点数目)。在这个例子中,我们可能会手动选择要合并的节点对。
如果你想要实际合并簇并跟踪过程,可以自定义一个函数,根据Z矩阵的层次顺序逐次合并:
```python
def merge_clusters(Z):
clusters = []
for i in range(len(Z)):
if i == 0 or Z[i][2] > some_threshold: # 某个阈值决定是否合并
# 获取当前簇的所有元素索引
cluster = np.arange(Z[i][0], Z[i+1][0]+1)
clusters.append(cluster)
else:
clusters[-1].extend(range(Z[i][0], Z[i+1][0]+1))
return clusters
clusters = merge_clusters(Z)
```
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