在一维点集(1,4,9,16,25,36,49,64,81)上执行层次聚类方法,假定簇表示其质心,每一次迭代中将最近的两个簇合并用python交。
时间: 2023-07-27 18:26:20 浏览: 56
好的,下面是使用 Python 实现基于最小距离的层次聚类方法的代码:
```
import numpy as np
from scipy.cluster.hierarchy import linkage, dendrogram
# 定义数据点
X = np.array([1, 4, 9, 16, 25, 36, 49, 64, 81]).reshape(-1, 1)
# 计算距离矩阵并进行层次聚类
Z = linkage(X, 'single')
# 生成树状图
dendrogram(Z, labels=X.flatten())
# 显示树状图
plt.show()
```
这段代码中,我们首先将数据点存储在一个 NumPy 数组 X 中,并将其转换为一个 (n, 1) 的二维数组,其中 n 是数据点个数。然后使用 `linkage()` 函数计算数据点间的距离矩阵,并进行层次聚类,这里使用的是最小距离法。最后使用 `dendrogram()` 函数生成树状图,并使用 `plt.show()` 函数显示树状图。
相关问题
在一维点集(1,4,9,16,25,36,49,64,81)上执行层次聚类方法,假定簇表示其质心,每一次迭代中将最近的两个簇合并,用python层次聚类方法
好的,您可以使用Python中的`scipy`库来执行层次聚类。以下是在给定的一维点集上执行层次聚类的Python代码:
```python
import numpy as np
from scipy.cluster.hierarchy import linkage, fcluster, dendrogram
import matplotlib.pyplot as plt
# 定义数据集
X = np.array([1, 4, 9, 16, 25, 36, 49, 64, 81])
# 定义距离函数
def dist_func(x, y):
return abs(x - y)
# 计算距离矩阵
Z = linkage(X, method='single', metric=dist_func)
# 绘制树状图
plt.figure(figsize=(10, 5))
dendrogram(Z, labels=X)
plt.show()
# 根据距离矩阵进行聚类
max_d = 10 # 设定最大距离
clusters = fcluster(Z, max_d, criterion='distance')
# 输出聚类结果
print('聚类结果:', clusters)
```
代码中使用`linkage`函数计算距离矩阵,`fcluster`函数根据距离矩阵进行聚类,`dendrogram`函数绘制树状图。在这个例子中,使用单链接聚类方法,并定义了距离函数`dist_func`。最大距离`max_d`设定为10,所有距离小于10的数据点被划分为同一个簇。输出结果为每个数据点所属的簇编号。
希望这个代码对您有所帮助!
编写python代码 在一维点集(1,4,9,16,25,36,49,64,81)上执行层次聚类方法,假定簇表示其质心,每一次迭代中将最近的两个簇合并
以下是在一维点集上执行层次聚类方法的 Python 代码实现,使用单链接算法来计算数据点之间的距离:
```python
import numpy as np
# 定义数据点
data = np.array([1, 4, 9, 16, 25, 36, 49, 64, 81])
# 定义距离函数
def distance(x, y):
return abs(x - y)
# 定义单链接算法的距离计算函数
def single_linkage_distance(cluster1, cluster2):
dist = np.inf
for x in cluster1:
for y in cluster2:
d = distance(x, y)
if d < dist:
dist = d
return dist
# 初始化簇
clusters = [[x] for x in data]
# 层次聚类
while len(clusters) > 1:
# 计算距离矩阵
dist_matrix = np.zeros((len(clusters), len(clusters)))
for i in range(len(clusters)):
for j in range(i+1, len(clusters)):
dist_matrix[i][j] = single_linkage_distance(clusters[i], clusters[j])
# 找到距离最近的两个簇
min_dist = np.inf
min_i = 0
min_j = 0
for i in range(len(clusters)):
for j in range(i+1, len(clusters)):
if dist_matrix[i][j] < min_dist:
min_dist = dist_matrix[i][j]
min_i = i
min_j = j
# 合并两个簇
clusters[min_i] += clusters[min_j]
del clusters[min_j]
# 输出当前聚类结果
print(clusters)
```
输出结果如下:
```
[[1, 4], [9], [16], [25], [36], [49], [64], [81]]
[[1, 4, 9], [16], [25], [36], [49], [64], [81]]
[[1, 4, 9, 16], [25], [36], [49], [64], [81]]
[[1, 4, 9, 16, 25], [36], [49], [64], [81]]
[[1, 4, 9, 16, 25, 36], [49], [64], [81]]
[[1, 4, 9, 16, 25, 36, 49], [64], [81]]
[[1, 4, 9, 16, 25, 36, 49, 64], [81]]
[[1, 4, 9, 16, 25, 36, 49, 64, 81]]
```
每一行表示一次迭代后的聚类结果。可以看到,每次迭代都会找到距离最近的两个簇并将它们合并,最终得到一个包含所有数据点的簇。