R语言OTU表的抽平

根据提供的引用，OTU表的抽平可以使用R语言中的`DESeq2`包来实现。具体步骤如下：

1. 安装`DESeq2`包

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("DESeq2")

2. 读取OTU表数据

otu_table <- read.table("otu_table.txt", header = TRUE, row.names = 1, sep = "\t")

3. 将OTU表数据转换为`DESeq2`包中的数据格式

library(DESeq2)
dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = otu_table, colData = NULL, design = ~ 1)

4. 进行抽平

rld <- rlog(dds, blind = FALSE)

其中，`rlog`函数是进行抽平的函数，`blind`参数表示是否盲化，即是否进行样本间的标准化。