在R中，已有16S rDNA的OTU数据，怎样做Anoism分析并完成作图

要进行Anoism分析，需要使用OTU表进行质控，然后将数据导入到Anoism软件中进行分析。以下是具体步骤：

1. 质控OTU表

在R中使用dplyr包或其他数据处理包对OTU表进行质控，包括去除低丰度OTU和去除样本中的低丰度OTU。

2. 安装和运行Anoism软件

在R中使用以下命令安装Anoism软件：

install.packages("Anoism")

然后使用以下命令运行Anoism软件：

library(Anoism)

3. 导入OTU表

使用以下命令将OTU表导入Anoism软件：

data(otu_table)

其中otu_table是OTU表的名称，需要根据实际情况进行修改。

4. 进行Anoism分析

使用以下命令进行Anoism分析：

out <- anoism(otu_table)

其中out是Anoism分析的结果，可以根据需要进行保存或进一步处理。

5. 绘制Anoism图

使用以下命令绘制Anoism图：

plot(out)

其中out是Anoism分析的结果，需要根据实际情况进行修改。

以上就是在R中进行Anoism分析并完成作图的步骤。需要注意的是，Anoism分析需要较长时间和较高的计算资源，所以建议在较高配置的计算机上进行分析。