dbscan聚类算法pytorch代码
时间: 2024-03-23 19:29:14 浏览: 321
dvs_dbscan_cnn_基于DVS的目标检测算法及FPGA实现_DBSCANFPGA_
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当然,我可以为您提供一个基于 PyTorch 的 DBSCAN 聚类算法的代码示例。DBSCAN 是一种基于密度的聚类算法,可以有效地发现具有足够密度的区域。以下是使用 PyTorch 实现的 DBSCAN 聚类算法代码:
```python
import torch
import numpy as np
def dbscan(X, epsilon, min_pts):
"""
:param X: 数据集(PyTorch Tensor)
:param epsilon: 邻域半径
:param min_pts: 邻域中最小点数
:return: 聚类结果(PyTorch Tensor)
"""
visited = torch.zeros(X.size(0), dtype=torch.bool)
noise = torch.zeros(X.size(0), dtype=torch.bool)
clusters = []
cluster_id = 0
for point_id in range(X.size(0)):
if visited[point_id]:
continue
visited[point_id] = True
neighbors = region_query(X, point_id, epsilon)
if neighbors.size(0) < min_pts:
noise[point_id] = True
else:
cluster = expand_cluster(X, point_id, neighbors, epsilon, min_pts, visited)
clusters.append(cluster)
cluster_id += 1
return torch.cat(clusters), noise
def region_query(X, point_id, epsilon):
"""
找到给定点的 epsilon-邻域内所有的点
:param X: 数据集(PyTorch Tensor)
:param point_id: 给定点的索引
:param epsilon: 邻域半径
:return: 邻域内的点的索引(PyTorch Tensor)
"""
return torch.nonzero(torch.sum((X - X[point_id])**2, dim=1) <= epsilon**2).squeeze()
def expand_cluster(X, point_id, neighbors, epsilon, min_pts, visited):
"""
从给定点开始拓展聚类
:param X: 数据集(PyTorch Tensor)
:param point_id: 给定点的索引
:param neighbors: 邻域内的点的索引(PyTorch Tensor)
:param epsilon: 邻域半径
:param min_pts: 邻域中最小点数
:param visited: 记录是否访问的标志(PyTorch Tensor)
:return: 聚类结果(PyTorch Tensor)
"""
cluster = [point_id]
for neighbor_id in neighbors:
if not visited[neighbor_id]:
visited[neighbor_id] = True
new_neighbors = region_query(X, neighbor_id, epsilon)
if new_neighbors.size(0) >= min_pts:
neighbors = torch.cat((neighbors, new_neighbors))
if neighbor_id.item() not in [point.item() for point in cluster]:
cluster.append(neighbor_id.item())
return torch.tensor(cluster)
# 示例使用
X = torch.tensor([[1.0, 1.0], [1.5, 2.0], [3.0, 4.0], [5.0, 7.0], [3.5, 5.0], [4.5, 5.0], [3.5, 4.5]])
epsilon = 0.5
min_pts = 3
clusters, noise = dbscan(X, epsilon, min_pts)
print("聚类结果:", clusters)
print("噪音点:", noise)
```
在这个示例中,我们使用纯 PyTorch 实现了 DBSCAN 聚类算法。首先定义了三个辅助函数:`region_query` 用于找到给定点的 epsilon-邻域内的所有点,`expand_cluster` 用于从给定点开始拓展聚类,`dbscan` 是 DBSCAN 算法的主要实现函数。
然后我们给出了一个数据集的示例,并调用 `dbscan` 函数进行聚类。最后打印出聚类结果和噪音点。
请注意,这只是一个简单的示例,实际应用中可能需要根据具体情况对代码进行修改和优化。
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