R语言如何对cox回归评价残差是否方差齐,举几个例子
时间: 2024-09-16 19:04:30 浏览: 63
在R语言中,Cox比例风险模型(Cox proportional hazards model)是一种用于生存分析的统计模型,它假设风险比在整个观察期内保持不变。为了评估模型拟合的残差方差是否均匀,我们通常检查残差图和结余生命表图,以及计算一些统计量如 Schoenfeld残差。
1. **残差图**:
使用`survminer`包的`ggsurvplot()`函数可以创建残差图,例如:
```R
library(survminer)
cox_model <- coxph(Surv(time, event) ~ variable1 + variable2, data = your_data)
ggcoxresidual(cox_model)
```
这会显示风险分数随时间变化的散点图,如果数据点随机分布在一条直线上,则表明方差齐。
2. **结余生命表图 (Survival Function plot)**:
可以通过`survfit()`函数生成结余生存函数,并绘制其与预测值的差异,查看是否有异常的趋势。
```R
sf <- survfit(cox_model, newdata = your_data)
ggsurvplot(sf, risk.table = TRUE)
```
3. **Schoenfeld残差检验**:
使用`spline()`函数从`rms`包计算Schoenfeld残差,然后做图形展示或进行统计检验(`anovaTest()`函数)看是否有线性趋势,表示方差非齐。
```R
library(rms)
schoenfeld_test <- anovaTest(cox_model, test="s")
plot(schoenfeld_test$wald)
```
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