python怎么把sdf文件中的分子切割成子结构

要将SDF文件中的分子切割成子结构，可以使用RDKit库。以下是一个示例代码，可以将SDF文件中的每个分子切割成子结构并保存到一个新的SDF文件中：

from rdkit import Chem

# 读入SDF文件
suppl = Chem.SDMolSupplier('input.sdf')

# 新建SDF文件
w = Chem.SDWriter('output.sdf')

# 对每个分子进行处理
for mol in suppl:
    # 获取分子中所有的子结构
    sub_mols = Chem.GetMolFrags(mol, asMols=True)
    
    # 对每个子结构进行处理
    for sub_mol in sub_mols:
        # 将子结构添加到新的SDF文件中
        w.write(sub_mol)
        
# 关闭SDF文件
w.close()

在上面的代码中，我们先使用`Chem.SDMolSupplier`函数读入SDF文件。然后，对于每个分子，我们使用`Chem.GetMolFrags`函数获取所有的子结构。最后，对于每个子结构，我们将其添加到新的SDF文件中，并使用`Chem.SDWriter`函数将其保存到文件中。