反式eQTL可以用来做孟德尔随机化吗

反式eQTL（trans-eQTL）是指位于不同染色体或目标基因远离的遗传变异位点。与顺式eQTL不同，反式eQTL通常涉及到更多的基因和调控元件，其影响机制更为复杂。

虽然反式eQTL也可以用于基因表达谱分析和发现潜在的调控元件，但是它们不太适合作为孟德尔随机化的工具变量。这是因为反式eQTL存在较强的基因间和元件间相关性，很难有效控制混杂因素的影响，从而可能导致因果关系的偏差。

因此，一般建议在孟德尔随机化中使用顺式eQTL作为工具变量，而不是反式eQTL。