R语言LIGHTGBM二分类
时间: 2023-11-26 07:03:31 浏览: 116
要使用R语言中的lightgbm包构建二分类的LightGBM模型,并输出二分类混淆矩阵,可以按照以下步骤进行操作:
1. 首先,安装并加载lightgbm包。使用以下命令安装包:
```R
install.packages("lightgbm")
```
加载包:
```R
library(lightgbm)
```
2. 准备数据集,将数据划分为训练集和测试集。假设你的数据集包含特征变量X和目标变量y。
```R
# 划分数据集
set.seed(123) # 设置随机种子,确保结果可复现
train_index <- sample(1:nrow(data), 0.7*nrow(data)) # 获取训练集索引
train_data <- data[train_index, ] # 获取训练集
test_data <- data[-train_index, ] # 获取测试集
```
3. 创建LightGBM模型,并进行训练。设置模型的参数和训练轮数。
```R
# 创建LightGBM模型
model <- lgb.train(
params = list(objective = "binary"),
data = lgb.Dataset(data = as.matrix(train_data[, -ncol(train_data)]), label = as.numeric(train_data$target)),
nrounds = 100,
verbose = 0
)
```
4. 使用训练好的模型进行预测,得到测试集预测结果。
```R
# 模型预测
pred <- predict(model, as.matrix(test_data[, -ncol(test_data)]))
```
5. 根据预测结果和真实标签,计算二分类混淆矩阵以及相关指标。
```R
# 计算混淆矩阵
confusion_matrix <- table(pred > 0.5, test_data$target)
# 计算准确率及其置信区间
accuracy <- sum(diag(confusion_matrix)) / sum(confusion_matrix)
confidence_interval <- binom.test(sum(diag(confusion_matrix)), sum(confusion_matrix))$conf.int
# 计算p值
p_value <- binom.test(sum(diag(confusion_matrix)), sum(confusion_matrix))$p.value
# 计算Kappa系数
kappa <- kappa2(confusion_matrix)
# 计算特异度和灵敏度
specificity <- confusion_matrix[1, 1] / (confusion_matrix[1, 1] + confusion_matrix[1, 2])
sensitivity <- confusion_matrix[2, 2] / (confusion_matrix[2, 1] + confusion_matrix[2, 2])
```
以上是使用R语言中的lightgbm包构建二分类的LightGBM模型,并输出二分类混淆矩阵以及相关指标的步骤。
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