tlr_temp=`ls 2_sequences/demux_no_primer_${libname}_qza/*_R2_* | xargs -i zcat {} | awk 'NR%4==2{print length}' | sort -n| uniq -c |awk '{print $2"\t"$1}' | awk -F '\t' '{a[NR]=$1;d[$1]=$2;b+=$2}END{for(i=1;i<=NR;i++){c+=d[a[i]];if(c/b>0.02)print a[i]}}' |head -n 1 `
时间: 2024-04-19 19:28:30 浏览: 18
这段代码是用于处理DNA测序数据的。首先,它使用`ls`命令获取文件夹`2_sequences/demux_no_primer_${libname}_qza/`中所有以`_R2_`结尾的文件的路径。然后,使用`xargs`命令将这些文件路径传递给`zcat`命令,并解压缩这些文件。接下来,使用`awk`命令来处理解压缩后的文件,首先筛选出每个序列的长度(第2行),然后按长度进行排序和去重,并统计每个长度出现的次数。接着,使用`awk`命令再次处理数据,将长度和出现次数以制表符分隔的形式输出。最后,使用`awk`命令计算累积频率,并找到第一个累积频率超过总频率2%的长度,并打印输出。
请注意,我只是解释了代码的功能,并不会真正执行代码。如果您还有其他问题,请随时提问!
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ls 按照时间排序
你可以使用 `ls` 命令的 `-t` 选项来按时间排序。默认情况下,`ls` 命令按名称排序。
如果你想要按时间倒序排序,可以使用 `-r` 选项。
例如,以下命令将按时间排序列出当前目录下的文件和文件夹:
```
ls -t
```
如果你想要按时间倒序排序,则可以使用以下命令:
```
ls -tr
```
如果你想要同时显示文件的详细信息(包括权限、所有者、大小、修改时间等),则可以使用 `-l` 选项,例如:
```
ls -tlr
```
这将以时间倒序的方式显示当前目录下的所有文件和文件夹的详细信息。
POC-亚姆-TLR-2005KSH-CVE-2021-45428
这是一个IT类问题,具体来说是一个安全漏洞的命名。POC代表"Proof of Concept",亚姆是指Apache的一个Web服务器,TLR是指Tomcat的日志记录器,2005KSH是指Apache Tomcat 5.5.20版本,CVE-2021-45428是指该版本中的一个已知漏洞。该漏洞可能允许攻击者通过精心构造的请求来执行远程代码。建议及时更新Tomcat以修复漏洞。