R语言中如何删除C:\Users\27895\Desktop\my_work\GSE9960_series_matrix.txt文件中缺失值的行
时间: 2023-10-30 08:07:59 浏览: 133
可以使用以下代码删除文件中缺失值的行:
```
data <- read.table("C:\\Users\\27895\\Desktop\\my_work\\GSE9960_series_matrix.txt", header=TRUE, sep="\t", row.names=1)
data <- data[complete.cases(data), ]
```
首先使用 `read.table` 函数读取文件,其中 `header=TRUE` 表示第一行为列名,`sep="\t"` 表示以制表符为分隔符, `row.names=1` 表示第一列为行名。然后使用 `complete.cases` 函数判断每行是否有缺失值,返回一个逻辑向量。最后使用这个逻辑向量筛选出不含缺失值的行。
相关问题
Python读取txt文件“GSE83148_series_matrix.txt”基因芯片文件和平台“GPL570-55999.txt”(跳过注释行),分别命名为df1和df2¶
好的,可以使用Python中的pandas库来读取这两个文件。代码如下:
```python
import pandas as pd
# 读取基因芯片数据
df1 = pd.read_csv('GSE83148_series_matrix.txt', sep='\t', skiprows=31)
# 读取平台数据
df2 = pd.read_csv('GPL570-55999.txt', sep='\t', skiprows=51)
```
其中,`pd.read_csv`函数可以读取以制表符为分隔符的txt文件。`skiprows`参数可以跳过注释行。`df1`和`df2`分别代表读取的两个数据框。
读取“GSE83148_series_matrix.txt”基因芯片文件和平台“GPL570-55999.txt”(跳过注释行),分别命名为df1和df2
可以使用 pandas 库中的 read_csv 函数来读取文本文件。对于“GSE83148_series_matrix.txt”基因芯片文件,可以使用以下代码:
```python
import pandas as pd
df1 = pd.read_csv("GSE83148_series_matrix.txt", sep="\t", skiprows=70, index_col=0)
```
这里使用了 pandas 中的 read_csv 函数,指定了文件名为“GSE83148_series_matrix.txt”,分隔符为制表符(`\t`),跳过了前 70 行(注释行),并将第一列作为索引列。
对于平台文件“GPL570-55999.txt”,可以使用以下代码:
```python
import pandas as pd
df2 = pd.read_csv("GPL570-55999.txt", sep="\t", comment="#", header=None, index_col=0)
```
这里同样使用了 pandas 中的 read_csv 函数,指定了文件名为“GPL570-55999.txt”,分隔符为制表符(`\t`),并跳过了以“#”开头的注释行。此外,由于平台文件没有标题行,因此需要将 header 参数设置为 None,同时将第一列作为索引列。
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