gset<-getGEO('GSE183899') Found 2 file(s) GSE183899-GPL18573_series_matrix.txt.gz GSE183899-GPL19057_series_matrix.txt.gz
时间: 2024-02-18 07:04:57 浏览: 159
GSE13355_series_matrix.txt.gz
根据你提供的信息,使用getGEO函数获取了GSE183899数据集,并发现该数据集有两个文件:GSE183899-GPL18573_series_matrix.txt.gz和GSE183899-GPL19057_series_matrix.txt.gz。
这是因为GEO数据库中的一个数据集通常会有多个平台,每个平台包含有不同的探针或基因信息。在这种情况下,每个平台的表达数据和注释信息通常会保存在不同的文件中。
你可以使用相同的方式获取每个平台的数据,或者使用getGEO函数的GSEMatrix参数来指定要获取的平台。例如,要获取GSE183899数据集中GPL18573平台的数据,可以使用以下命令:
```r
gse <- getGEO('GSE183899', GSEMatrix = 'GSE183899-GPL18573_series_matrix.txt.gz')
```
类似地,要获取GPL19057平台的数据,可以使用以下命令:
```r
gse <- getGEO('GSE183899', GSEMatrix = 'GSE183899-GPL19057_series_matrix.txt.gz')
```
这样,你就可以获取每个平台的表达数据和注释信息,并对它们进行进一步的分析和可视化。
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