如何载入"C:\\Users\\27895\\Desktop\\my_work\\GSE131761_series_matrix.txt.gz"的数据
时间: 2023-10-05 13:14:37 浏览: 56
要加载"C:\\Users\\27895\\Desktop\\my_work\\GSE131761_series_matrix.txt.gz"的数据,您可以按照以下步骤进行操作:
1. 导入所需的库:
```python
import gzip
import pandas as pd
```
2. 使用gzip库打开.gz文件:
```python
with gzip.open("C:\\Users\\27895\\Desktop\\my_work\\GSE131761_series_matrix.txt.gz", "rb") as f:
data = f.read()
```
3. 将数据转换为字符串,并将其分割为行列表:
```python
data = data.decode("utf-8")
lines = data.split("\n")
```
4. 创建一个空的DataFrame,并逐行解析数据并添加到DataFrame中:
```python
df = pd.DataFrame()
for line in lines:
if line.startswith("!"): # 跳过以'!'开头的注释行
continue
if line.strip() == "": # 跳过空行
continue
row = line.split("\t")
df = df.append(pd.Series(row), ignore_index=True)
```
现在,您可以使用`df`变量来访问加载的数据。