Python读取txt文件“GSE83148_series_matrix.txt”基因芯片文件和平台“GPL570-55999.txt”(跳过注释行),分别命名为df1和df2¶
时间: 2024-03-05 18:52:35 浏览: 28
好的,可以使用Python中的pandas库来读取这两个文件。代码如下:
```python
import pandas as pd
# 读取基因芯片数据
df1 = pd.read_csv('GSE83148_series_matrix.txt', sep='\t', skiprows=31)
# 读取平台数据
df2 = pd.read_csv('GPL570-55999.txt', sep='\t', skiprows=51)
```
其中,`pd.read_csv`函数可以读取以制表符为分隔符的txt文件。`skiprows`参数可以跳过注释行。`df1`和`df2`分别代表读取的两个数据框。
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python读取“GSE83148_series_matrix.txt”基因芯片文件和平台“GPL570-55999.txt”(跳过注释行),分别命名为df1和df2¶
可以使用pandas的read_csv函数读取文本文件,并使用skiprows参数跳过注释行。假设这两个文件与Python脚本在同一目录下,可以使用以下代码实现:
```
import pandas as pd
# 读取基因芯片文件
df1 = pd.read_csv('GSE83148_series_matrix.txt', skiprows=31, sep='\t')
df1 = df1.transpose() # 将数据框转置,使基因为列
# 读取平台文件
df2 = pd.read_csv('GPL570-55999.txt', skiprows=31, sep='\t')
```
这样就将“GSE83148_series_matrix.txt”基因芯片文件和平台“GPL570-55999.txt”读入了两个数据框df1和df2中,其中df1为转置后的基因芯片数据框。
读取“GSE83148_series_matrix.txt”基因芯片文件和平台“GPL570-55999.txt”(跳过注释行),分别命名为df1和df2
可以使用pandas中的read_csv函数来读取txt文件,并通过参数skiprows来跳过注释行。具体操作如下:
```python
import pandas as pd
# 读取"GPL570-55999.txt"平台文件,跳过注释行
df2 = pd.read_csv('GPL570-55999.txt', sep='\t', skiprows=lambda x: x.startswith('!'))
# 读取"GSE83148_series_matrix.txt"基因芯片文件,跳过注释行
df1 = pd.read_csv('GSE83148_series_matrix.txt', sep='\t', skiprows=31)
# 打印读取结果
print(df1)
print(df2)
```
上述代码中的文件路径根据实际情况进行修改。其中“GPL570-55999.txt”文件跳过注释行的方法是,注释行以!开头,可以使用`skiprows=lambda x: x.startswith('!')`来跳过。而“GSE83148_series_matrix.txt”文件的注释行在前31行,可以使用`skiprows=31`来跳过。