https://github.com/conda-forge/miniforge/releases
时间: 2024-09-02 22:03:40 浏览: 108
您提到的是Miniforge项目的GitHub发布页面。Miniforge是一个轻量级、自包含的Anaconda发行版,它包含了Conda包管理工具以及一个预配置的基础科学计算环境。用户可以下载预构建的Miniforge版本,或者选择构建自己的版本,以便在不依赖系统默认Anaconda的情况下独立安装和管理Python及其相关的科学库。
该页面列出了不同版本的Miniforge,包括Windows、macOS和Linux系统的安装包,供用户根据操作系统和需求选择适合的下载。每个版本通常会附带详细的操作指南,帮助用户快速设置和开始使用。此外,它还提供了一些社区支持资源,如常见问题解答和贡献指南。
相关问题
# 配置SNaQ主要环境 conda install -c conda-forge mamba conda create -n phylo python=3.8 conda activate phylo mamba install -c bioconda -c conda-forge raxml julia ## julia install_julia.jl wget http://pages.stat.wisc.edu/~ane/bucky/v1.4/bucky-1.4.4.tgz tar -zxvf bucky-1.4.4.tgz cd bucky-1.4.4/src make mv bucky ~/miniconda3/envs/phylo/bin/ mv mbsum ~/miniconda3/envs/phylo/bin/ cd ../.. wget http://research.haifa.ac.il/~ssagi/software/QMCN.tar.gz tar -zxvf QMCN.tar.gz mv find-cut-Linux-64 ~/miniconda3/envs/phylo/bin/find-cut-Linux-64 mv genTreeAndQuartets-Linux-64 ~/miniconda3/envs/phylo/bin/genTreeAndQuartets-Linux-64 mv quartet-agreement-Linux-64 ~/miniconda3/envs/phylo/bin/quartet-agreement-Linux-64 wget https://codeload.github.com/nstenz/TICR/zip/refs/heads/master unzip TICR-master.zip cd TICR-master/src make mv mdl ~/miniconda3/envs/phylo/bin/ cd ../.. conda deactivate # 配置mrbayes环境 ## 安装beagle提高运算效率 wget https://github.com/beagle-dev/beagle-lib/archive/refs/tags/v3.1.2.tar.gz tar -zxvf beagle-lib-3.1.2.tar.gz cd beagle-lib-3.1.2 ./autogen.sh ./configure --prefix=/usr make -j4 make install ## 安装mrbayes wget https://github.com/NBISweden/MrBayes/releases/download/v3.2.7/mrbayes-3.2.7.tar.gz tar -zxvf mrbayes-3.2.7.tar.gz cd mrbayes-3.2.7/ ./configure --prefix=/usr # mrbayes和beagle安装的位置必须能通过用户.bashrc直接调用,后续SNaQ的脚本批量执行时不能调用conda环境 make -j4 make install
这段代码是一段 Bash 脚本,用于配置 SNaQ 和 mrbayes 环境。其中,SNaQ 是一个用于基于序列数据估计物种树的软件包,mrbayes 是一个用于基于贝叶斯方法估计物种树的软件。
首先,使用 conda 安装 mamba,并创建一个名为 phylo 的虚拟环境,并在该环境中安装 RaxML 和 Julia。然后,下载并安装 BUCKy 和 QMCN 软件包,将安装后的可执行文件移动到环境变量 PATH 中。接着,退出 phylo 虚拟环境。
然后,配置 mrbayes 环境。首先,下载并安装 BEAGLE 库,用于提高 mrbayes 运算效率。然后,下载并编译安装 mrbayes。需要注意的是,mrbayes 和 BEAGLE 库安装的位置必须能通过用户的 .bashrc 直接调用,这样才能保证后续 SNaQ 的脚本批量执行时能够调用这些软件包。
需要注意的是,这段代码中涉及的软件包版本和安装方式可能已经过时,如果要在实际应用中使用,需要根据具体情况进行修改和更新。同时,这段代码中涉及的软件包都需要具备一定的使用经验和相关知识才能正确配置和使用。
cartopy利用conda install -c conda-forge cartopy 安装特别慢
如果使用conda install安装Cartopy特别慢,可能是由于网络连接问题或conda源的速度较慢导致的。您可以尝试以下方法来解决这个问题:
. 更换清华大学的Anaconda镜像源:可以使用以下命令将Anaconda镜像源切换为清华大学的镜像源,以提高下载速度:
```
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --set show_channel_urls yes
```
2. 使用pip安装:您可以尝试使用pip来安装Cartopy,因为pip的下载速度可能会比conda更快。在命令提示符或PowerShell中执行以下命令:
```
pip install cartopy
```
或者如果您使用的是Python 3.7及以上版本,可以尝试使用以下命令:
```
python -m pip install cartopy
```
3. 下载预编译的二进制文件:Cartopy官方提供了预编译的二进制文件,您可以从其GitHub页面(https://github.com/SciTools/cartopy/releases)下载适用于您的操作系统和Python版本的二进制文件,并手动安装。
请注意,无论您选择哪种方法,都可能需要一些时间来下载和安装Cartopy及其依赖项。如果仍然遇到问题,请确保网络连接稳定,并尝试在不同的时间段进行安装,以避免高峰期。
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