pearson_score
时间: 2023-08-16 14:02:10 浏览: 43
Pearson积差相关系数(Pearson correlation coefficient)是一种常用的统计量,用于衡量两个变量之间的线性相关程度。Pearson相关系数的取值范围为-1到1,其中1表示完全正相关,-1表示完全负相关,0表示无相关。
Pearson积差相关系数的计算方法是利用两个变量的协方差除以它们各自的标准差的乘积。具体公式为:r = Cov(X, Y) / (SD(X) * SD(Y)),其中r为Pearson积差相关系数,Cov(X, Y)表示X和Y的协方差,SD(X)和SD(Y)分别表示X和Y的标准差。
Pearson积差相关系数可以用来判断两个变量之间的关系强度和方向。如果r的值接近1,则说明两个变量之间存在强正相关性;如果r的值接近-1,则说明两个变量之间存在强负相关性;如果r的值接近0,则说明两个变量之间无明显的线性相关性。
Pearson积差相关系数的优点是简单、直观,并且可以用来处理数值型变量。然而,它有一个前提假设,即两个变量的相关关系是线性的。如果两个变量之间存在非线性关系,Pearson积差相关系数可能会失效。
总之,Pearson积差相关系数是一种常用的统计指标,用于描述两个变量之间的线性相关程度。它的计算简单,但仅适用于线性相关的情况。在实际应用中,我们可以通过计算Pearson积差相关系数来了解变量之间的关系强度和方向。
相关问题
get_r_from_bsen函数
get_r_from_bsen函数是一个自定义函数,用于计算给定的beta值、标准误(se)和样本量(sample size)所对应的Pearson相关系数(即R值)。函数的代码可能类似于以下内容:
```
get_r_from_bsen <- function(beta, se, sample_size) {
z_score <- beta/se
p_value <- 2*pnorm(abs(z_score), lower.tail=FALSE)
t_value <- qt(p_value/2, df=sample_size-2, lower.tail=FALSE)
r_value <- t_value/sqrt(t_value^2 + sample_size-2)
return(r_value)
}
```
该函数首先计算z分数(z_score),然后转换为双侧P值(p_value),接着计算t值(t_value),最后计算Pearson相关系数(r_value)并返回结果。
from sklearn.metrics import RocCurveDisplay from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.metrics import confusion_matrix,accuracy_score from sklearn.preprocessing import StandardScaler from sklearn.linear_model import LogisticRegression from sklearn import tree from sklearn.decomposition import PCA import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier data = pd.read_csv("C:\\Users\\sa'y\\Desktop\\framinghamData(1).csv") X = data[["sysBP", "diaBP", "age", "totChol", "BMI", "heartRate", "glucose"]] y = data[['TenYearCHD']] new_data = pd.concat([X, y], axis=1) print(new_data.head()) scaler = StandardScaler() X_scaled = scaler.fit_transform(X) print(X_scaled) corr = new_data.corr(method='pearson') sns.heatmap(corr, annot=True, cmap='coolwarm') plt.show() pca = PCA(n_components=7) newX = pca.fit_transform(X) x_data = ['PC1','PC2','PC3','PC4','PC5','PC6','PC7'] y_data = np.around(pca.explained_variance_ratio_, 2) plt.bar(x=x_data, height=y_data,color='steelblue', alpha=0.8) plt.show() 在上述代码基础上,请给出下一步的代码,要求是: 计算所有主成分之间的皮尔逊相关系数,并用热图Heatmap的形式展示出来
import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt
import seaborn as sns
# 计算所有主成分之间的皮尔逊相关系数
corr_pca = np.corrcoef(newX.T)
# Heatmap展示相关系数
sns.set(font_scale=1)
sns.heatmap(corr_pca, cbar=True, annot=True, square=True, fmt='.2f', annot_kws={'size': 10}, yticklabels=x_data, xticklabels=x_data)
plt.savefig('corr_pca_heatmap.png')
plt.show()