基因聚类分析的时使用fpkm还是TPM
时间: 2023-09-16 09:13:50 浏览: 179
聚类分析
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基因聚类分析时,建议使用TPM(Transcripts Per Million)作为基因表达量的计算方法。因为TPM能够考虑到基因长度和测序深度的影响,可以更加准确地反映基因表达量。而FPKM(Fragments Per Kilobase of exon per Million fragments mapped)则只考虑了基因长度的影响,没有考虑到测序深度的差异,因此不够准确。
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