图的节点数,边数,节点集和边集是什么
时间: 2023-09-23 14:13:01 浏览: 79
在图论中,一个图可以用节点和边来描述。节点表示图中的元素,边表示节点之间的关系。以下是节点数、边数、节点集和边集的定义:
1. 节点数:一个图中的节点数量被称为节点数,通常用符号 $n$ 表示。
2. 边数:一个图中的边的数量被称为边数,通常用符号 $m$ 表示。
3. 节点集:一个图中所有的节点的集合被称为节点集,通常用符号 $V$ 表示。
4. 边集:一个图中所有的边的集合被称为边集,通常用符号 $E$ 表示。
因此,一个无向图可以用 $(V, E)$ 表示,其中 $V$ 是节点集,$E$ 是边集;有向图可以用 $(V, A)$ 表示,其中 $V$ 是节点集,$A$ 是有向边集。
相关问题
将上述计算的节点数和边放入基因之间关系的边列表edges
要将计算得到的节点数和边数放入基因之间关系的边列表 `edges` 中,你可以修改代码如下:
```python
import pandas as pd
import networkx as nx
import numpy as np
# 读取FPKM数据文件,假设文件名为fpkm_data.csv,第一列为基因名称,后续列为FPKM值
data = pd.read_csv('fpkm_data.csv')
# 提取基因名称和FPKM值
gene_names = data.iloc[:, 0].values
fpkm_values = data.iloc[:, 1:].values
# 计算基因之间的Pearson相关系数
correlation_matrix = np.corrcoef(fpkm_values, rowvar=False)
# 创建共表达网络
coexpression_network = nx.Graph()
# 添加节点
coexpression_network.add_nodes_from(gene_names)
# 添加边及相关性作为边的权重
num_genes = len(gene_names)
edges = []
for i in range(num_genes):
for j in range(i + 1, num_genes):
correlation = correlation_matrix[i, j]
if abs(correlation) > 0.7: # 设置相关性阈值,只保留相关性大于0.7的边
coexpression_network.add_edge(gene_names[i], gene_names[j], weight=correlation)
edges.append((gene_names[i], gene_names[j]))
# 打印共表达网络的节点数和边数
print("节点数:", coexpression_network.number_of_nodes())
print("边数:", coexpression_network.number_of_edges())
# 打印基因之间关系的边列表
print("基因之间关系的边列表:", edges)
```
在上述代码中,我们添加了一个名为 `edges` 的列表,用于存储基因之间的关系边。在遍历基因之间的相关性矩阵时,如果相关性大于阈值,我们将边添加到共表达网络中,并将该边的两个基因名称作为一个元组 `(gene_names[i], gene_names[j])` 添加到 `edges` 列表中。
最后,我们打印共表达网络的节点数和边数,并输出基因之间关系的边列表 `edges`。
请注意,这仅是一个示例,你可以根据需求对代码进行修改和扩展。
matlab 如何获得特定节点和边的图柄
在 MATLAB 中,可以使用 `gobjects` 函数创建一个对象数组来存储图形对象的句柄。然后,可以使用 `findobj` 函数来查找特定节点和边的句柄。
首先,让我们创建一个简单的图形对象作为例子:
```matlab
% 创建一个图形窗口
figure;
% 添加一些节点和边
hNode1 = scatter(0, 0, 'filled'); % 第一个节点
hNode2 = scatter(1, 1, 'filled'); % 第二个节点
hEdge = line([0 1], [0 1]); % 边
% 设置节点和边的属性
set(hNode1, 'MarkerFaceColor', 'red');
set(hNode2, 'MarkerFaceColor', 'blue');
set(hEdge, 'LineWidth', 2);
```
现在,我们可以使用 `findobj` 函数来查找特定节点和边的句柄。例如,如果我们要查找红色节点的句柄,可以执行以下操作:
```matlab
% 查找红色节点的句柄
redNodeHandle = findobj('MarkerFaceColor', 'red');
```
同样,如果我们要查找边的句柄,可以执行以下操作:
```matlab
% 查找边的句柄
edgeHandle = findobj('Type', 'line');
```
通过这种方式,您可以根据特定的属性值来查找特定节点和边的图柄。请注意,`findobj` 函数还可以用于查找其他类型的图形对象,例如文本、图像等。